第一篇:《分子生物学与基因工程》课程论文
植物基因工程研究进展
摘要:自1983年美国人首先成功地获得抗卡那霉素的烟草再生植株开始,人类就开始了植物基因工程的研究。至今已在逾200种植物中成功地获得了转基因植株,并有近1000例转基因植物获准进行田间试验,更有十余种转基因植物(如转基因棉花.大豆)已进入商业化种植.转基因产品已进入人们日常生活。植物基因工程的应用已进入蓬勃发展阶段。下面是我从植物基因工程改善生物质能利用的研究进展做一说明。
关键词:木质纤维素 细胞壁 水解酶
近几年来全世界对能源的需求量急剧增加加速了对有限的不可再生矿物质 能源的消耗资源的利用也增加了CO2及粉尘的排放,造成环境破坏和全球气候变 化[1]可再生的清洁的生物质能成为人们关注的热点。其中的燃料乙醇工业,近年来在世界范围内得到了广泛的发展,我国也大力支持发酵乙醇用作能源[2]。目前,绝大部分乙醇来源于玉米淀粉发酵生产。但是由于淀粉本身又作为食品和饲料,产量有限,成本较高,阻碍了乙醇工业的发展。于是,人们把注意力转移到谷物秸秆等廉价 的含有大量 的木质 纤维素 的生物质 材料上希望 能够被 充分利用 [3]。但由于木质纤维素本身难以分解,许多研究利用 基 因工程 方法 改善植物,使自生产生的多糖资源更利于降解,用于发酵产乙醇。1.木质纤维素发酵生产乙醇发展现状
在中国,大约每年会产生10t亿农林业废弃物这些资源用于造纸、纺织或者直接作为燃料这些占到很少一部分。绝大部分被废弃了木质纤维素是光合作用的基本产物 , 也是生物圈产生的最充足的可再 生生物资源被认为是地球上最丰富的生物高分子聚合[4]。
大部分的高等植物细胞壁由胶联多糖、糖蛋白和木质素组成双 子 叶植物 , 如拟南芥等,细胞壁多糖主要有三种:纤维素半、纤维素和果胶质,包埋在非 纤 维多糖基质(半纤维素和果胶)中的纤维素网络,与木质素和结构蛋白共同构成植物细胞壁的聚合液晶结构[5]天然状态下由于木质素的保护作用,阻碍了水解 纤维素酶与纤维素的接触并发挥作用,成为影响纤维素水解的重要因素 [3, 4]。YangB等人发酵降解实验证明,虽然半纤维素对纤维素。也有一定保护作用 , 但木质素的去除对于纤维素有效降解是最关键的[6]。一般对木质纤维素材料 的利用,首先要进行粉碎,然后预处理(酸碱处理等),最后 添 加 微 生物 来源 的纤维素复合水解酶类,使之与处理过的木质纤维充分接触,将其降解为单糖 , 从而用于乙醇发酵。现在虽然前期的粉碎和预处理工艺研究取得了很大进展但成本仍然较高,而且后期发酵分解处理。要添加来源于微生物的纤维素水解复合酶,价格仍十分昂贵[7]。这些因素导致目前用木质纤维素作为这些因素 导致 目前用木质纤维素作为原料发酵产乙醇,成本较高发展缓慢因此,现在对木质纤维素进行高效降解使用,仍然是个很大的难题。2.植物基因工程与植物木质纤维素利用
近年来随着生物技术的不断进步,人们开始尝试利用植物基因工程方法来 解决植物木质纤维素有效利用问题研究主要集中在改善植物细胞壁木质纤维素结构和含量比例等方面,使植物多糖资源利于降解使用,或者利用植物作为生物反应器,在植物内表达微生物来源的强活性纤维素降解酶,使植物自身表达高活性纤维素水解 酶类等研究。2.1 改善植物细胞壁的结构与组成
过去几十年的研究,改善木质素含量及细胞壁已成为可能。利用基 因工程方法,控制植物内木质素合成相关基因的表达,可以改变木质素结构和含量木质素对纤维素形成的保护作用是导致 纤维素资源利用 的主要障碍,降低木质素含量或改变其结构,将利于纤维素 的分解[8]。虽然植物体木质素的合成过程还不是十分清楚,但近几年的研究,已使大量降低木质素含量成为可能。
在玉米和苜蓿的研究中发现,木质素合成单体之一的芥子醇, 其前体的甲基化合成酶基因COMT(caffeate/5-hydroxyferulate O-methyltransferase),如果被抑制表达,芥子单体含量会明显减少,可导致木质素含量降低 [9, 10]但是在杨树中抑制这种酶的表达却不能够改善材质,木质素含量反而增加[11]。Li L等人在杨树中研究发现,通过反义表达4CL基因(4-coumarate-CoA ligase)时,木质素含量了减少了约40%,并且导致10%的纤维素含量的增加,如果正义表达控制木质素组成单体紫丁香基丙 烷(syringyl)和愈疮木基丙烷(guaiacyl)比率的CAld5H基因(Coniferaldehyde 5-hydroxylase),可导致紫丁香基丙烷的量明显增 高,但木质素含量没有变化[12]。当两基因同时转化时,木质素含量减少可达53%,紫丁香基丙烷含量进一步增加,而纤维素含量能够增加30%。Cano-Delgado A等人研究拟南芥CESA3突变体发现,纤维素合成酶受损时,导致了木质素大量合成[13]这表明在植物木质部细胞中可能存在一种调控机制,当木质素含量减少时,为了维持支撑作用,纤维素含量会相应增加。Chabannes M等人在烟草中研究发现,同时抑制CCR(Cinnamoyl CoA reductase)和 CAD(Cinnamyl alcohol dehydrogenase)的表达,可大量减少木质素含量,但非预期 的还引起了细胞壁多糖酚类物质及可溶性酚类物质含量的变化[14]等人在番茄中抑制表达木质素合成相关的CCR基因,导致木质素含量降低,同时与木质素形成具有共同前体的酚类复合物增加[15]。Boudet AM等人通过抑制杨树木质素合成酶基因CCR,可导致植物细胞壁纤维 素成分更容易被纤维素分解菌Clostridium产糖量达到原来的2倍[16]这表明,降低木质素等物质含量后,非常利于纤维资源的利用。Li Y等人研究发现,过氧化酶影响了木质化过程[17]。Blee KA等人在烟草中反义抑制过氧化酶FBP1(French bean cationic peroxidase)同系物表达,在不影响植物生长发育的情况下,使木质素含量降低了40%~50% [18]。通过基因工程方法,改变木质素结构与含量的方法改善植物细胞壁结构,利于作为能源植物,具有重要的研究价值。
2.2 植物体内表达木质纤维素水解酶
过去几十年的发展,植物已成功的作为重组蛋白表达的生物反应器,它相对于微生物和动物表达的优势是具有较低的成本已在多种植物里面进行了异源重组蛋白的表达研究(如疫苗和工业用酶等),蛋白表达量高且保持了很好的生物学活性[19]。近几年,人们开始在植物体内进行微生物来源的研究,希望这些植物作为生物反应器,大量表达并在细胞内积累纤维素酶。收获的植物,经过粉碎和预处理(酸碱处理等)后,在分解过程中能利用自身表达的酶,不添加加来源于微生物的酶,就可以将纤维素充分分解为单糖, 进一步用于生产乙醇,降低生产成本(Sticklen M,2006)[20]。考虑到细胞质表达对植物生长影响较大,一般采用定向胞外或细胞器积累表达(如定向质外体叶绿体溶酶体等)Ziegler MT等人在拟南芥中,定向质外体,积累表达了来源于Acidothermus cellulolyticus的耐热内切-β-1,4-葡聚糖酶(Endo-1,4-β-glucanase),表达量约达到叶子总可溶性蛋白的26%,并且保持了很好的活性[21],同样是在拟南芥中,Hyunjong B等人定向叶绿体和过氧化酶体,积累表达来源于Trichoderma reesei的木聚糖酶(Xylase),达到了总可溶性蛋白的4.6%,明显 高于细胞质表达和单一细胞器定向表达[22]在烟草中Dai Z等人定向叶绿体,积累表达了A.cellulolyticu 的耐热内切-β-1,4-葡聚糖酶,达到总可溶性蛋白的1.35%[23]。Dai Z等人采用同样的酶,比较了定向不同细胞器积累表达的差异,发现定向质外体表达蛋 白量最高,且保持了较好的活性[24]。在其它的植物中,也进行了相关的研究, Xue GP等人在大麦的胚乳中,特异表达来源于Neocallimastix patriciarum 的内切-β-1,4-葡聚糖酶,约达到了总种子蛋白的1.5%[25]。Oraby H 等人在水稻中,定向质外体积累表达了A.cellulolyticu耐热内切-β-1,4-葡聚糖酶,达到了叶子总可溶性蛋白的 4.9%。
目前的研究集中于将植物作为生物反应器,尽可能多的表达并积累纤维素酶,用于后期的处理。在发酵分解过程可以利用植物自身表达的异源纤维素水解酶,节省了额外添加酶的量。表达 的大都是内切-β-1,4-葡聚糖酶或木聚糖酶,为了预处理后还 能保持较好活性,多采用稳定性强的耐高温酶。由于纤维素有效降解需要复合水解酶,并且木质素对其具有很强的保护作用,这些植物不会发生自身降解。3.前景与展望
利用不断发展的植物基因工程技术,在能源植物研究方面已经取得了不错的研究进展。但是,目前要实现廉价充分的利用纤维资源,还有一定的困难。通过对植物细胞壁合成 代谢研究的不断深入,应该能够获得对自身生长发育不影响的低木质素植物细胞壁木质素结构及含量改善纤维素含量增加,利于降解发酵产乙醇。还希望最终能够获得一种能源植物,这种植物通过自身表达异源的高活性木质纤维水解复合酶,酶的表达受到诱导调控,收获前诱导表达,收获后送往生物能源发酵工厂。这期间,木质纤维素多糖在植物体内也可进行持续降解,在发酵工厂只需添加一些简单的辅助分解酶就可以彻底降解掉,使木质纤维资源产乙醇变得十分简单 参 考 文 献: 1.Dorian JP, Franssen HT, Simbeck DR.Energy Policy, 2006, 34 : 1984~1991.2.Yang B, Lu Y.J Chem Technol Biotechnol, 2007, 82 : 6~10.3.Himmel ME, et al.Science, 2007, 315 : 804~807.4.Ding SY, Himmel ME.J Agric Food Chem, 2006, 54(3): 597~606.5.Cosgrove DJ.Nat Rev Mol Cell Biol 2005 6 11 850~861.6.Yang B Wyman CE.Biotechnol Bioeng 2004 86 1 88~95.7.Kabel MA, et al.Biotechnol Bioeng, 2005, 93 : 56~63.8.Ragauskas AJ, et al.Science, 2006, 311 :484~489.9.Piquemal J et al.Plant Physiol 2002 130 4 1675~1685.10.Guo D et al.Transgenic Res 2001 10 5 457~464.11.Pilate G et al.Nat Biotechnol 2002 20 6 607~612.12.Li L et al.Proc Natl Acad Sci USA 2003 100 8 4939~4944.13.Cano Delgado A, et al.Plant J, 2003, 34(3): 351~362.14.Chabannes M et al.Plant J 2001 28 3 257~270.15.van der Rest B et al.J Exp Bot 2006 57 6 1399~1411.16.Boudet AM Kajita S Grima Pettenati J et al.Trends Plant Sci2003 8 12 576~581.17.Li Y et al.J Plant Res 2003 116 3 175~182.18.Blee KA, et al.Phytochemistry, 2003, 64(1): 163~176.19.Streatfield SJ.Plant Biotechnol J 2007 5 1 2~15.20.Sticklen M.Curr Opin Biotechnol 2006 17 3 315~319.21.Ziegler MT, Thomas SR, Danna KJ.Mol Breed, 2000, 6 : 37~46.22.Hyunjong B, Lee DS, Hwang I.J Exp Bot, 2006, 57 : 161~169.23.Dai Z, Hooker BS, Anderson DB, et al.Transgenic Res, 2000, 9(1):43~54.24.Dai Z, et al.Transgenic Res, 2005, 14(5): 627~643.25.Xue GP et al.Plant Cell Rep 2003 21 11 1088~1094.
第二篇:分子生物学与基因工程结课论文
《分子生物学与基因工程》
结课论文
Real-Time PCR在分子生物学中的应用
姓
名:XXX 学
号:AXXXXXXX 院
系:生命科学学院 班
级:生科XXX班 任课教师:XXX
二零一二年十二月 Real-Time PCR在分子生物学中的应用
XXX XXX大学生命科学学院 黑龙江哈尔滨 150xxx
摘 要:聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)可对特定基因进行扩增,因此被广泛应用于分子生物学领域中获取特定基因或基因片段。定量PCR已经从基于凝胶的低通量分析发展到高通量的荧光分析技术,即实时定量PCR(real-time quantitative PCR)。该技术实现了PCR从定性到定量的飞跃,且与常规PCR相比,它具有特异性强、灵敏度高、重复性好、定量准确、速度快、全封闭反应等特点,目前实时定量PCR作为一个极有效的实验方法,已被广泛地应用于分子生物学研究的各个领域,成为了分子生物学研究中的重要工具。关键词:实时定量PCR;基因扩增;分子生物学
1971年Khorana等最早提出PCR理论:―DNA变性解链后与相应引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,重复该过程便可克隆tRNA 基因‖。因当时基因序列分析方法尚未成熟、热稳定DNA聚合酶还未发现及寡聚核苷酸引物合成仍处于手工和半自动阶段,核酸体外扩增设想似乎不切实际,且Smith等已发现了DNA限制性内切酶,使体外克隆基因成为可能,Khorana 等的早期设想被忽视。1985年Mullis等用大肠杆菌DNA聚合酶 ⅠKlenow片段体外扩增哺乳动物单拷贝基因成功以及1988年Saiki等将耐热DNA聚合酶(Taq酶)引入PCR,使扩增反应的特异性和效率大大提高,并简化了操作程序,最终实现了DNA扩增的自动化,迅速推动了PCR的应用和普及。
自从PCR技术问世便很快成为科研、临床诊断的热点技术。但是传统PCR技术在应用中一是不能准确定量,二是容易交叉污染,产生假阳性。直到1996年由美国Applied Biosystems公司推出的实时荧光定量PCR技术,上述问题才得到较好的解决[1]。实时荧光定量PCR(real-time fluoro-genetic quantitative PCR,FQ-PCR)是通过对PCR扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测从而实现对起始模板定量及定性的分析。在实时荧光定量 PCR反应中,引入了一种荧光化学物质,随着PCR反应的进行,PCR反应产物不断累计,荧光信号强度也等比例增加。每经过一个循环,收集一个荧光强度信号,这样就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线图。该技术不仅实现了对DNA模板的定量,而且具有灵敏度高、特异性和可靠性强、能实现多重反应、自动化程度高、无污染性、具实时性和准确性等特点,目前已广泛应用于分子生物学研究和医学研究等领域[2]。
1.实时荧光定量PCR技术概述
1.1 实时荧光定量PCR原理
1992年Higuchi等首次提出了采用动态PCR方法和封闭式检测方式对目的核酸数量进行定量分析,荧光探针技术是基于标记基团的FRET原理而实现的,当某个荧光基团的发射谱与另一个荧光基团的吸收光谱重叠,且两个基团距离足够近时,能量可以从短波长(高能量)的荧光基团传递到长波长(低能量)的荧光基团,相当于短波长荧光基团释放的荧光被屏蔽,这个过程称为FRET。在探针5’端标记一个报告基团(R),在3’端标记一个淬灭基团(quencher,Q),两者距离很近时(7-10nm),报告基团发出的荧光能被淬灭基团所吸收,并依赖其较高的S/N比值(信-噪比, signal-to-noise ratio)和良好的辨别能力进行定量检测。
荧光扩增曲线扩增曲线可以分成三个阶段:荧光背景信号阶段,荧光信号指数扩增阶段和平台期。在荧光背景信号阶段,扩增的荧光信号被荧光背景信号所掩盖,无法判断产物量的变化。而在平台期,扩增产物已不再呈指数级的增加。PCR的终产物量与起始模板量之间没有线性关系,所以根据最终的PCR产物量不能计算出起始DNA拷贝数。只有在荧光信号指数扩增阶段,PCR产物量的对数值与起始模板量之间存在线性关系,可以选择在这个阶段进行定量分析。为了定量和比较的方便,在实时荧光定量 PCR 技术中引入了两个非常重要的概念:荧光阈值和CT值。荧光阈值是在荧光扩增曲线上人为设定的一个值,它可以设定在荧光信号指数扩增阶段任意位置上,但一般将荧光域值的缺省设置是3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数被称为CT值(threshold value)。CT值与起始模板的关系研究表明,每个模板的CT值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,CT值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代表Ct值。因此,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。[4][3]1.2 常用实时荧光定量PCR分类
1.2.1 实时荧光定量PCR荧光染料法
实时荧光定量PCR荧光染料法包括非饱和染料SYBR Green法和饱和染料LC Green法[5]。非饱和染料SYBR Green染料法定量成本低,方法简便,不需要设计探针,但是特异性低。荧光染料能和任何dsDNA结合,因此它也能与非特异的dsDNA(如引物二聚体)结合,使实验容易产生假阳性信号。引物二聚体的问题目前可以用带有熔解曲线(melting curve)分析的软件加以解决。饱和染料LC Green法与SYBR染料法工作原理是一样的,但与传统的荧光染料SYBR Green相比有如下优点:LC Green染料在进行PCR 时可以以饱和的浓度加入,不会抑制PCR反应,而Sybr Green 染料浓度过高会抑制PCR反应。从而,利用LC Green染料可以进行高分辨率熔解曲线分析。在进行HRM分析时,由于饱和染料占据了DNA双链上每一对碱基上的空位,所以在双链解链时,染料立即与双链脱离,使得荧光信号发生较大的变化,而非饱和染料常发生位置上的迁移,从而对荧光信号没有大的影响。除LC Green染料外,常用的染料还有Reso Light、Ever Green等,这些都是绿色荧光染料,最佳激发波长范围440-470nm,发射荧光波长470-520nm。
1.2.1 实时荧光定量PCR探针法
实时荧光定量PCR寡核苷酸探针法包括TaqMan探针法和TaqMan-MGB探针法。TaqMan 探针法技术原理是利用Taq酶的5’—3’外切酶活性,在传统PCR技术一对特异性引物的基础上增加了一条荧光双标记探针。该探针可与上、下游引物之间的DNA模板序列特异性结合。探针的5’端标以荧光报告基团,3’端标以荧光淬灭基团。在PCR退火复性期,探针与DNA模板特异性结合。在PCR延伸阶段,Taq酶在引物的引导下,沿着模板合成新链,当移动至探针结合的位置时便发挥其5’—3’外切酶活性将探针降解成单核苷酸,使得荧光报告基团与淬灭基团分离,前者的荧光信号释放并被检测。因此,每合成一条新链就有一个探针被裂解并释放出一个荧光信号。荧光信号强度与PCR产物量相对应。
MGB探针与传统的TaqMan探针比较,有很大的优势。它可以使探针的长度缩短,尤其对AT含量高的序列的 MGB探针的设计有很大的帮助;同时可以提高配对与非配对模板间的Tm值差异; 由于在探针的3’端的Quencher基团为不发光的荧光基团,并且与Report基团在空间的位置更接近,使杂交的稳定性大大提高,实验的结果更精确,分辨率更高,可 以进行SNP分析。MGB探针实验步骤简单,使杂交的重复性大大提高。
1.3 实时荧光定量PCR定量方法
在实时荧光PCR中,模板的定量有两种方法:绝对定量和相对定量。绝对定量指用已知的标准曲线来推算未知的样本量;相对定量指在一定样品中靶序列相对于另一参照序列的量的变化。由于每个模板的CT值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,利用已知起始DNA浓度的标准品可做出标准曲线。
1.3.1 绝对定量法
该方法是利用标准品作一条标准曲线,通过标准曲线对样本进行定量。绝对定量标准品一般是用质粒DNA或是PCR扩增产物等制备的。标准品的量根据260nm的吸光度值计算得出。由于样本的浓度完全是通过标准曲线来确定,所以合适的标准品是定量准确的关键。一方面标准品与未知样本应具有一致的扩增效率,另一方面标准品的定量必须准确。这就要求标准品的扩增序列与样本完全一致,制备的标准品纯度要高,不应含有影响定量的因素如Dnase、标准品与未知样本各自反应体系内的干扰因素要一致等。该方法的优点就是测定范围很广(10~1010拷贝),结果可直接通过软件得出,不需额外计算。1.3.2 相对定量法
相相对定量是指在测定目的基因的同时测定某一内源性管家基因,该管家基因主要是用于核苷酸的拷贝数的比较、反映反应体系内是否存在PCR扩增的影响因素,通常选用的管家基因有GAPDH、β-2微球蛋白和rRNA。使用的β-actin、相对定量较为早期的方法是用一系列已知外参物做标准曲线,根据该标准曲线得到目的基因和管家基因的量,再将目的基因同管家基因的比值作为定量的最后结果。此种方法计算出未知样品的量是相对于某个参照物的量而言,因此,相对定量的标准曲线比较容易制备,对于所用的标准品只需知道其稀释度即可。在整个试验中,待测样品的量来自于标准曲线,最终必须除以参照基因的量,即参照基因是1×的样本,其他的样本为参照基因的n倍。由于管家基因在各种组织中的恒定表达,所以可用管家基因的量来作为标准,以比较来源不同的样本,目的基因表达量的差异,此即相对定量。这一方法的缺陷是要求外参、目的基因和管家基因的扩增效率一致;此外加入已知起始拷贝数的内标相当于是进行双重PCR反应,存在两种模板相互的干扰和竞争[7]。
1.3.3 相对定量反应循环值(Ct)比较法
[6]即ΔCT值法,该方法是同时扩增待测靶基因片段和一个作为内参照的基因片段,一般是一个内源性管家基因片段。这两个扩增反应可在2管中分别进行,也可在同一反应管中进行,测得两者的CT值之差,即ΔCT。该方法不需要标准曲线。它是根据PCR扩增反应的原理,假设每个循环增加倍的产物数量PCR反应的指数期得到扩增产物的值来反映起始模板的量通过数学公式来计算相对量。比较Ct法与标准曲线法的相对定量的不同之处在于其运用了数学公式来计算相对量,前提是假设每个循环增加一倍的产物数量,在PCR反应的指数期得到Ct值来反应起始模板的量,一个循环(Ct=1)的不同相当于起始模板数2倍的差异。比较不同待测标本DNA的ΔCT值与正常标本DNA的ΔCT值的变化,即可对未知标本靶基因的原始拷贝数作出判断,从而对病理状态进行判断或诊断。但是此方法是以靶基因和内源控制物的扩增效率基本一致为前提的,效率的偏移将影响实际拷贝数的估计[8]。最终结果也是靶序列和参考品的相对比值。该方法需确定靶序列和参考品的扩增效率是否一致;如不一致,则会影响结果的准确性。
2.实时荧光定量PCR技术的应用
实时定量PCR的应用非常广泛。在科研方面,可定量分析各种基因的表达[ 9 ]、分析基因变和多态性[ 10 ]、分析细胞因子的表达
[ 11 ]、单核苷酸多态性(SNP)
[ 12 ]
测定及易位基因的检测
[ 15 ]
[ 13 ]
等;在医疗方面,可用于免疫组分分析
[ 14 ]、临床疾病早期诊断、病原体检测、耐药性分析
[ 16 ]、肿瘤研究[ 17 ]和微小残留病变(MRD)[ 18 ]检测等。
以下就其在基因工程研究、病原体的检测和肿瘤分子诊断等方面的应用及其新进展作一简述。2.1 基因工程研究领域
实时荧光定量技术的出现不仅加强了有关对基因的量的研究方法,而且也加强了对基因的质所发生变化的研究。它可以检测基因突变和基因组的不稳定性,已经被广泛应用于遗传分析[19]。
2.1.1
基因表达研究
由不同的荧光报告基团标记的探针分别与野生型和突变基因杂交,探针杂交的效率和其后的切除与杂交有关。如果一种染料的荧光信号明显强于另一种,说明它是一个纯合子,如果荧光信号都增加则表明是一个杂合子。从使用范围来看,它能用于检测已知基因序列的任何遗传病基因的突变和缺失及表达量的异常,从灵敏度方面看,它能从单细胞进行特异基因扩增,实现植入前基因诊断。PCR技术还可用于端粒酶的检测。使用双色荧光标记探针,结合不同的引物设计,可以实现对某些先天性疾病的定量检测。应用实时荧光定量PCR方法对β地中海贫血症(β地贫)患者β与γ球蛋白mRNA水平进行检测,其结果特异性强、定量准确,为了解β地贫的分子病理机制及其临床诊断提供了可靠的检测数据。迄今对遗传性物质改变引起的疾病还无法根治,只能通过产前监测和产前基因诊断,减少病婴出生[20]
。因此,实时荧光定量PCR方法可用于产前监测和产前基因诊断。
2.1.2
单核苷酸多态性(SNP)及突变分析
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。实时荧光定量PCR一个诱人的应用前景是用于检测基因突变和基因组的不稳定性[21]。基因突变的检测基于两条探针,一条探针横跨突变位点,另一条为锚定探针,与无突变位点的靶序列杂交。两条探针用两种不同的发光基团标记。如靶序列中无突变,探针杂交便完全配对,如有突变,则探针与靶序列不完全配对,会降低杂交体的稳定性,从而降低其熔解温度(Tm)。这样便可对突变和多态性进行分析。
2.1.3
转基因研究
Tesson等确定了实时定量PCR的技术条件,利用两种发光探针及适当的循环域值,扩增一个转移后的基因和一个对照基因,以分析转基因鼠的接合性[22]。同型结合的和异质接合的动物交配后其子代中转基因的传递情况符合孟德尔遗传规律,通过实时定量PCR检测,该方法为转基因动物的同型结合及异质接合提供了明确的鉴定结果。这项技术在转基因动物繁育及基因剂量功能效应实验中将有很大用途。
2.2 肿瘤的分子诊断
肿瘤的本质是细胞内基因发生了变化,是一种多基因异常的疾病,这些异常变化用实时荧光定量PCR方法都可以检测出来。目前用此方法进行过端粒酶hTERT基因、慢性粒细胞性白血病ER基因、肿瘤MDR1基因等,尽管肿瘤发病的分子机制尚未完全阐明,但相关基因的遗传学改变的积累是致癌性转变的根本原因之一已得到普遍承认[23]。癌基因的突变和表达增加,在许多肿瘤早期就出现。实时荧光PCR技术不仅能有效地检测到基因的突变,而且可以准确检测癌基因的表达量。如定量结直肠癌淋巴结的癌胚抗原(CEA)mRNA的表达量,可作为诊断癌症微转移的重要依据[24]。目前,肿瘤患者的生存期已有所延长,但是缓解期的患者仍存在复发的危险,因此,微小残留病变的检测对于进一步调整治疗方案至关重要。实时荧光PCR技术正成为检测肿瘤微小残留分子标志的一种必备工具[25]。Eckert等提出采用实时荧光PCR技术检测儿童急性淋巴细胞白血病微残留病灶,对儿童急性白血病的治疗有重要指导意义。
2.3 病原体的分子检测
目前,用此方法还进行了对人类结核杆菌、免疫缺陷病毒、肝炎病毒、流感病毒、巨细胞病毒、EB病毒等病原体的检测[26]。同样在国内,2004年针对SARS流行性病的检测和诊断使得荧光定量PCR技术得以应用和发展。荧光定量PCR问世后的几年中,积累了大量有关病原体核酸量与感染性疾病发生、发展和预后之间关系的资料,这些研究资料不断丰富,将形成感染性疾病的临床分子诊断标准。目前, 实时荧光PCR技术已应用于肝病、性病以及人类免疫缺陷病毒(HIV)等各种病原体的临床诊断,为实现快速准确诊断提供了有效的检测方法。
3.小结
时荧光定量PCR与其他一些技术的结合应用,是今后发展的方向,如与高级微型解剖技术结合后,能提高形态学损伤所至低水平扩增的检测能力[ 27 ]、可定量分析石蜡包埋储存样本中的核酸[ 28]及少量细胞中的全部转录产物[ 29 ]等。此外,微阵列实验中所选基因表达水平的测定仍需使用实时PCR技术[ 30 ,31 ],利用该技术还可使等位基因特异表达分析以及生化武器证据甄别成为可能。
通过设计针对目的基因的特异性引物和探针,并优化反应体系和反应循环参数,已成功地建立了快速、灵敏、特异的Q-PCR检测方法。可实现大量样本同时检测,并节省大量试验时间和反应成本,为基因定量检测和准确定量疾病相关基因的表达提供了有效的技术手段;同时实现对人类和动物疾病的早期诊断与基因分期、分型,以及对人类肿瘤转移的早期发现及预后判断[32]。因此Q-PCR技术将成为未来分子生物学实验室必备的研究工具,在临床上将有更加广阔的应用前景。
参考文献:
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第三篇:基因工程课程论文
基因治疗在传染病防治中的应用研究进展
姓名(学号)(学校 邮编)
[摘要] 传染病是目前人类所面临的一类重大疾病,在某些疾病状态下,人类还未寻找到理想的治疗方法,如病毒感染等。现代基因治疗是一种应用基因工程技术和分子遗传学原理,对人类疾病进行治疗的新疗法。主要是指对致病基因的修正和基因增强及采用外源性细胞因子基因、核酶、基因药物进行疾病治疗的方法。经过几十多年的发展,技术逐步走向成熟,在传染性疾病的防治中显示了重大的临床应用前景。传染性疾病的基因治疗包括:基因疫苗、RNA干扰、胞内抗体、淋巴基因表达等。
[关键词] 基因疫苗 RNA干扰 胞内抗体 淋巴基因表达 1.现状
1.1 我国传染病现状 21世纪人类依然面临着传染病的挑战首先,是新发传染病的挑战。就全球而言,艾滋病是当前首恶,因其主要通过血液、吸毒、性行为传播,潜伏期长、隐袭性强、控制难度大;特别是妇女感染率高且可以垂直传播,严重危害儿童的身体健康。由于其病毒极易发生变异,所以到目前为止疫苗仍在试验阶段,缺乏理想的特效药物,免疫损伤治疗难度大,以致非洲个别国家感染人数达其全国人口的一半。我国2003年比2002年发病率上升44.39%,人类免疫缺陷病毒检出率提高了55%。2004新年伊始在东北亚韩国、日本及东南亚越南、泰国、柬埔寨以及中国和美国部分地区禽流感暴发,导致大量家禽死亡,同时H5N1病毒在人群感染使20多人丧命,又一 次引起全球震惊。更有严重者,引起疯牛病(在人类称为克雅克病)的朊毒蛋白对煮沸等常用消毒方法不起作用,疾病潜伏期长,病死率高达100%。这两种传染病不但对人类健康造成了威胁,而且给人的两种主要食物—— 牛肉、禽肉的供应造成困难。由于人与动物关系的密切,气候的变化,以及化学物质的广泛应用,微生物发生变异导致新的传染病,甚至恐怖主义制作生物武器,人类势必将面临更多的新的挑战。其次,老的传染病对人类健康的影响同样不容忽视。以2002年为例,WHO统计全球发生各类传染病共计356 824 000例次,占各病种总发病数的23.9%,位居第一,死亡共11 122 000例,占19.5%,仅次于心血管病⋯。这说明就全球而言,特别是发展中国家,传染病不可忽视。据中国疾病预防控制中心报道,我国传染病同年发病2 320 764例,死亡4520例,病死率0.0195%,均远低于全球平均水平。但近年除新发传染病外,传统性传染病一些情况值得我们注意:(1)发病数和发病率:我国2002年全国传染病报告发病数2 440 588例次,发病率比2001年下降了5.74%,而2003年发病数2 591 512例次,发病率比2002年上升5.45%。(2)死亡例数和病死率:从死亡人数看,2002年死亡4520例,比前一年死亡3576例增加了26.4%,且2003年比2002年同期又上升了17.43%,增加了1280例。2003年死亡人数中死于SARS者349例,狂犬病1980例,且后者比2002年增加821例,高于SARS。(3)病种分布:2002年和2003年发病数居前3位的均是病毒性肝炎、结核与细菌性痢疾,死亡人数居前3位的是狂犬病、肺结核及病毒性肝炎,其中乙型病毒性肝炎及结核无论发病率及死亡数均居前3位。乙型肝炎疗效有限,加上慢性化、肝硬化及部分发生肝癌呈链式发展,危害人民健康。同样,最老的传染病结核主要由于耐药增加近年全球复燃,我国亦面临结核的严重挑战。2003年其余死亡数位居前 10位的其他传染病还有新生儿破伤风、艾滋病、乙型脑炎、SARS、细菌性痢疾、出血热、流行性脑脊髓膜炎。其中除SARS及艾滋病外,均是老的传染病控制不力出现反复。儿童传染病死亡原因以破伤风、中毒性菌痢、麻疹与流行性脑膜脊髓炎为主,说明传染病主要危害儿童的特点,影响了国家优生优育的大计。
1.2 基因治疗研究现状
1.2.1 多种疾病的基因治疗 目前,基因治疗的范围已从过去罕见的单基因疾病扩大至常见的单基因疾病和多基因疾病。遗传性疾病的基因治疗多数属于单基因缺陷所引起的疾病的基因治疗。Fang等以腺病毒为载体,靶向肝细胞对苯丙氨酸羟化酶(PAH)缺陷症小鼠模型进行了研究,结果表明小鼠的伤寒表型症状得到明显改善。而un等则通过反转录状病童T淋巴细胞中苯丙氨酸羟化酶(PAH)活性的改变状况。恶性肿瘤的基因治疗已进行了大量的预备性实验,美国科学家构建了重组的TIL(肿瘤浸润淋巴细胞),能表达100倍于正常水平的TNF并应用于黑色素瘤的临床治疗。另外,用表达IL-
2、IFN.2和IL广1的TIL治疗神经母细胞瘤及白等的研究工作也已见报道;还有应用反转录病毒将毒素基因(蓖麻毒素和脊髓灰质炎病毒素中所含的一种蛋白酶的基因)导人癌细胞内,只在靶细胞内表达毒素并发挥杀伤作用,但对其他细胞毒性较低。对于艾滋病等传染类基因疾病,有研究将HIV LTR3’、5’寡腺苷酸合成酶杂合基因转染HeLa.T4+细胞。结果表明:经修饰的带有CD4受体的细胞具有抗HIV感染的作用。还有将编码可使艾滋病毒HIV RNA降解的核酶基因转染人淋巴细胞,从而抑制HIV的传播。
1.2.2 多种药物的基因治疗随着对基因治疗机制本身的不断深人探讨,用于基因治疗的药物形式也不断创新。基于三链DNA形成脱氧寡核苷酸('rro)[3]的反基因技术能够通过阻止基因转录和DNA复制而达到治疗目的。Cohen等曾用此技术抑制淋巴瘤的bc1.2基因,而Noonberg等以此对乳腺癌的HER2基因进行了相应的探索。基因治疗从传统意义上的DNA治疗扩展至RNA水平。有治疗作用的目的基因的mRNA已用作体内、体外基因治疗的研究。Nair等Is J从肿瘤细胞或活组织分离出mRNA,以其对自身提呈抗原的树突细胞进行转染,最终表达出了初始癌抗原(CEA)一T淋巴细胞特异性细胞毒素。Thierry等采用体外转录的方式,以GFP为报告基因,研究了mRNA在人脐静脉内皮细胞(HUVEC)、鼠黑色素瘤细胞B16.F10、人海拉细胞(子宫颈癌组织细胞株HeLa)、鼠成纤维细胞Ratl等不同细胞系中的表达状况,同时还探讨了不同转染试剂对转染效果的影响,并以蜂毒素肽介导并提高了mRNA的转染效率。1.2.3 多种途径的基因治疗在探讨不同疾病的发病机制、尝试不同基因药物,进行基因治疗的同时,有研究者对基因治疗的新方法新途径进行了大胆的探索。斯坦福大学研究组采用转座子作为基因载体,在患有血友病的小鼠模型上,将来自鱼的一种编码转座酶的基因与宿主染色体上的凝血因子Ⅸ 基因相连接,使小鼠的血液凝结状况大大改善。基因枪法被证明能够介导外源基因快速进人靶器官。Takuji等利用基因枪将成骨蛋白.1基因转入椎间盘细胞中并使其获得有效表达。Weiss等利用基因枪将包裹的细菌疏螺旋体OspC蛋白基因打人Balb/c小鼠体内,介导了Th2反应,并与注射方式进行比较,发现基因枪只介导Th2反应而非Thl反应的原因并非是由于相比注射方式其所输送的DNA数量太少,于CpG的临界浓度所致。利用消化道大量的黏膜表面以及其中所含有丰富的免疫介导组织,以口服的方式将具有治疗或免疫作用的目的基因1199运送到靶器官已成为基因治疗领域研究的热点。在以腺病毒为载体对肠上皮细胞进行转导的研究中,During等Luj将带有lacZ基因的 腺伴随病毒口服给乳糖不耐症的小鼠模型,在祖干细胞、肠道细胞、固有膜细胞中,外源基因的表达可持续六个月。MacLaughlin等用壳聚糖作为运送报告基因(编码氯霉素乙酰转移酶基因)的载体,经消化道后在体内得到表达。另外,Sizemore等发现当减毒的志贺氏菌进人细胞传递质粒后,质粒编码的B半乳糖苷酶引起黏膜免疫。Ayub等用减毒的沙门氏菌为载体,携带李斯特病菌的单细胞基因毒力因子,对小鼠管饲后发现明显的细胞毒性及辅助T细胞反应,同时也检测到特异性抗体的产生[4]。
2.基因治疗的方法
2.1 基因疫苗
基因疫苗及DNA疫苗是20世纪90年代发展起来的第3代疫苗。其原理是将编码病原体抗原的基因分离纯化,克隆至真核细胞表达质粒载体,经皮下、肌肉注射或口服等方式进入机体,基因在体内表达相对应抗原并刺激机体免疫系统产生特异性免疫应答,从而使机体获得针对病原微生物、病毒的特异性抵抗能力,达到预防和治疗传染病的目的。与传统的第1代疫苗一减毒、脱毒病原微生物成分及第2代疫苗一基因工程蛋白多肽相比,基因疫苗具有能把抗原以自然状态形式提供给机体、保护力强、无毒力回复并对不同亚型病原体产生交叉抵抗、易于制备和联合接种、生产成本低、易于保存和运输等优点,已成为具有广泛应用前景的新型生物技术。它不仅可用来预防和治疗细菌、病毒、寄生虫等传染性疾病,而且在肿瘤、自身免疫性疾病的治疗中具有重要的价值。DNA疫苗是利用分子生物学技术,根据编码抗原碱基序列,设计并合成特异性引物,用RT—PCR方法从病原微生物RNA分离纯化抗原基因,再通过限制性内切酶方法将DNA克隆至真核细胞表达质粒载体。通过特定的方法将质粒载体制备成注射制剂或口服制剂。当这 种制剂进入机体后通过载体的作用,DNA可进入机体细胞,在细胞内表达。病原抗原滞留于细胞内或分泌到细胞外,滞留于细胞内的抗原可特异性活化CD8+ Tc细胞,分泌到细胞外的抗原可活化CD4+ Th细胞或刺激B细胞产生抗体。因此,DNA疫苗不仅可诱导体液免疫,还可诱导细胞免疫,比传统疫苗只诱导体液免疫具有显著的优越性。
2.2 RNA干扰 RNA干扰主要是利用双链RNA在mRNA水平关闭特异序列基因表达或使其沉默的过程,又称转录后基因沉默(post—transcriptional gene silencing.PT—GS),能特异性使外源性入侵基因沉默。RNA干扰最早在植物和线虫细胞中发现,被认为是它们抵抗病毒感染的一种天然免疫防御机制。目前普遍认为其机制是核糖核酸酶首先将双链RNA切割成21~23个核苷酸的片段,然后酶又与片段结合,由这些片段将酶引导至特异的mRNA上,从而降解mRNA,使特异基因沉默,抑制基因表达[1]。
2.3 胞内抗体
胞内抗体是一种基因工程抗体。其方法是采用分子生物学手段,从免疫脾细胞或杂交瘤细胞分离纯化抗体VH和VL基因片段。再通过特定的连接肽将VH和VL连接起来,构建单链抗体(ScFv)基因,并在基因上加上细胞滞留信号序列,将该基因克隆至真核细胞表达质粒载体,通过特定的方法将质粒载体制备成注射制剂或口服制剂。当这种制剂进入机体后通过载体的作用,DNA可进入机体细胞,表达单链抗体定向分布于细胞的核、胞浆或特定细胞器中与病毒蛋白结合,干扰病毒蛋白的分泌、加工和活性,从而阻止病毒复制和病毒颗粒组装释放[1]。
2.4淋巴因子转基因表达
淋巴因子在传染病治疗中具有十分重要的作用和广泛的应用前景。其中的干扰素(IFN)已成为目前抗肝炎病毒治疗唯一公认有效的基因工程药物。利用淋巴基因表达进行传染病的基因治疗研
[1]究,是基因治疗在传染病中的一个重要应用和重要的研究方向[2]。2.5 反义RNA 彭国平[5]综述中谈到HBV、HCV是引起慢性肝炎以及肝硬化、肝细胞肝癌等相关疾病的重要病原体,而有效防治此类肝病的关键在于抗病毒,反义核酸技术最早是人工合成或生物合成特定互补的DNA或RNA 序列导入靶细胞,形成mRNA—DNA 或mRNA—RNA杂交双链,从而抑制或封闭靶基因表达,达到基因控制和治疗的目的[5]。
3.基因治疗在传染病防治中的应用
3.1 DNA疫苗
乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)基因疫苗在国外已进入I期临床实验,其结果显示:该疫苗可在体内有效表达HBsAg,并可诱导强烈的免疫反应,产生高效价抗体,同时,志愿者对疫苗具有良好的耐受性。我国科学家将S抗原基因与IL一
2、INF基因连接在同一载体上,构建融合基因给健康小鼠、HBV转基因小鼠使用后,发现CTL活性显著升高,HBsAg特异T细胞增殖能力显著高于对照组,血清抗HBs抗体显著升高。HIV一1基因疫苗在动物体内可产生有效的免疫应答,减少病毒颗粒释放和对T细胞的损害,在人体内的实验证明它可有效诱导抗HIV抗体产生。沙眼衣原体MOMP—DNA疫苗给小鼠免疫后可有效诱导抗体产生,其效价高达1: 1250,脾细胞对衣原体的刺激指数显著高于对照组,说明该基因疫苗不仅诱导了体液免疫,同时还诱导了细胞免疫[1]。
3.2 RNA干扰(RNAi)近年来随着对RNA干扰研究的深入,一种能在哺乳动物细胞中抑制特异基因表达、只有21个核苷酸的小干扰双链RNA(small interfering RNA,siRNA)被发现。将特异的siRNA通过阳离子脂质体转入Hela细胞和人胚肾293细胞等不同哺乳动物细胞中,获得了可重复的序列 特异的RNA干扰,而将长序列的双链RNA转入则出现了非特异抑制。这些研究成果为RNA干扰的研制提供了前提。Randall等人发现HCV特异的siRNA可抑制AC和Huh一7肝细胞株中HCV复制,清除细胞内HCV病毒[1]。3.3 胞内抗体
在传染性疾病,尤其是病毒感染中的应用越来越受到人们的关注。抗HIV结构和功能蛋白scFv基因导入HIV感染的淋巴细胞后能干扰HIV病毒转录和复制,而对细胞生长和CD4表达无影响,将其导入表达有CD4和CCR的人骨肉瘤细胞,可抵抗HIV的感染。抗HIV逆转录酶和抗整合酶的胞内抗体可抑制酶活性,减少病毒复制。抗CCR5和CD4的胞内抗体可抑制CCR5和CD4的表达并防止HIV感染。抗HCV外膜蛋白E2的胞内抗体能抑制病毒与靶细胞结合,发挥治疗作用。抗HCV核心抗原的ScFv能抑制核心蛋白功能和HCV的装配。我国研究者成军等人报道:将抗HBV核心抗原SeFv基因克隆至逆转录病毒载体,构建的重组逆转录病毒感染2 215细胞后能有效抑制Ⅶ 和HBsAg的表达。
3.4 干扰素的基因转移与表达
Seif等将小鼠的干扰素β(IFNβ)的基因置于主要组织相容性复合体(MHC)的启动子序列的控制之下,构建重组表达载体,转染Babl/c小鼠的成纤维细胞系NIH3T3,得到了持续的IFNβ的表达。表达IFNβ的细胞系,对滤泡口炎病毒(VSV),脑心肌炎病毒(EMCV)和塞姆利基森林病毒(Semliki forest virus)的复制和表达均有明显的抑制作用。并发现持续低水平的IFNβ的分泌表达,就可以使这一细胞系产生明显的抗病毒状态。然而,用等量的外源重组的IFNβ则无此效果。而且,加入相应的IFNβ的单克隆抗体并不能阻断这种转导的细胞系对上述三种病毒的抑制效应。因此认为,此细胞系的抗病毒状态的产生,除了和分泌型IFNβ的表达有关以外,还有可能存在其它的作用方式。另外,Bednarik
[1]等将人的α2干扰素(IFNα2)的基因重组到人免疫缺陷病毒(HIV)的长未端重复序列(LTR)中的启动子下游,转入非洲绿肾细胞系中,IFNα2的分泌表达水平持续在50~150u/ml之间。这一低水平的IFNα2的表达完全可以抑制HIV的复制和转录。同样地也发现就用相应水平的外源重组的IFNα2也无此效果。而且IFNα2的单抗也不能阻断IFNα2的抗病毒作用。这一差别的原因,作者认为体内产生的IFNα2与体外重组的IFNα2的抗病毒机理不同。外源重组的IFNα2的抗病毒机理,是抑制HIV的成熟和装配过程,而内源表达的IFNα2的抗病毒作用,似乎是主要作用在转录水平以及HIV mRNA的稳定性等方面[2]。问题与展望
基因治疗在染性疾病的体内外实验生物治疗中均显示了疗效。尤其是基因疫苗对机体的保护作用已得到了公认,但其真正进入临床广泛应用尚有一段距离。还有许多问题须要进一步的验证: 4.1 基因疫苗编码抗原的表达问题。基因疫苗使用时进入机体的是一段DNA片段,其作用的发挥须要DNA在细胞内有效转录和翻译成相应的蛋白,如何能使DNA高效率进入机体细胞并得到高效转录和翻译;
4.2 DNA疫苗目前的动物实验显示其免疫效果存在较大的个体差异,总的来看其免疫原性不高
4.3 RNA干扰目前虽然是一个研究热点,但其研究工作才起步,其导人体内的方法、稳定性等问题还需要解决;
4.4 基因治疗的安全性问题,尤其是选用的载体对机体的影响还须要进一步证实,这一问题在短时间内无法解决。4.5 伦理道德方面的争论也是影响因素之一。4.6 基因转移中的副作用和抗体形成问题。
虽然基因治疗还存在如此诸多问题,但它的理论基础和强大生命力是显而易见的。经过几年来的发展,基因治疗的研究已逐步从理论走向了临床的实验,人们已获得了不少宝贵的知识与经验,随着分子生物学、免疫学的发展,人类及细菌、病毒等基因组测序的完成,为进一步发展和完善基因治疗奠定了良好的基础,相信不久的将来,基因治疗将在传染性疾病的预防和治疗中发挥重要作用。
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第四篇:动物基因工程课程论文
青岛农业大学 动物基因工程课程论文
题 目:
核酸分子杂交技术
姓 名:
学 院: 动物科技学院 专 业: 班 级: 学 号:
任课教师: 闵令江
二〇一二年四月二十日
…1…
核酸分子杂交技术
闵令江
闵令江
摘要:核酸分子杂交是核酸研究中一项最基本的实验技术,其基本原理就是应用核酸分子的变性和复性的性质,使来源不同的DNA(RNA)片段按碱基互补关系形成杂交双链分子。杂交双链可以在DNA链和DNA链之间,也可以在RNA链和DNA链之间形成。杂交的实质就是在一定条件下使互补的核酸链实现复性,使双螺旋解开成为单链。变性指核酸双螺旋区的氢键断裂,变成单链的无规则线团,使核酸的某些光学性质和流体力学性质发生改变,有时部分或全部生物活性丧失,并不涉及共价键的断裂。复性指变性DNA在适当条件下,两条彼此分开的链重新缔合成为双螺旋结构的过程。核酸分子杂交具有灵敏度高、特异性强等优点,主要用于DNA或RAN的定性、定量检测。该技术已取得巨大突破,在医学诊断中应用广泛,而且DNA芯片技术已取得显著成就。
关键词:核酸分子
杂交
变性
复性
应用+
…2…
Nucleic acid member hybrid technology
majoring in Animal Medicine
Name GaoZhiCan
MiLingJiang
MiLingJiang Abstract: Nucleic acid hybridization in nucleic acids research is one of the most basic experimental technique, its basic principle is the application of nucleic acid denaturation and refolding of the nature, sources of DNA(RNA)fragment bases complementary relationship forming hybrid double-stranded molecules.Hybrids between double-stranded DNA DNA chain and chain, can also be formed between the DNA and RNA chains chains.Nature of the hybrid is the complementary nucleic acid chain under certain conditions of realization of complex, make double helix solved a single chain.Modified double helix of nucleic acids hydrogen bonds break, into a single chain of random coil so changed for some optical properties and fluid mechanics properties of nucleic acid, sometimes partial or total loss of biological activity, does not involve the breaking of covalent bond.Refolding of denatured DNA under appropriate conditions, two separate chains of association become the double-helix structure of process again.Nucleic acid hybridization with high sensitivity, specificity, and other advantages, mainly for qualitative and quantitative detection of DNA or RAN.The technology have made great breakthrough, widely used in medical diagnosis and DNA Microarray Technology has made remarkable achievements.Key words: Nucleic acid molecules Hybrid Degeneration Renaturation Application
…3…
引言
1961年Hall开拓了液相核酸杂交技术的研究,自此以后,由于分子生物学技术的迅猛发展,特别是20世纪70年代末到80年代初,分子克隆技术的出现、质粒和噬菌体DNA的构建成功、核酸自动合成仪的诞生,大大核酸探针的来源,新的核酸分子杂交类型和方法不断涌现。按其作用方式可大致分为固相杂交和液相杂交两种:液相杂交是指参加反应的两条核酸链都游离在溶液中,而固相杂交是将参加反应的一条核酸链固定在固体支持物的支持物上,另一条参加反应的核酸链则游离在溶液中。
常用的固相杂交类型有菌落原位杂交、斑点杂交、Southern印迹杂交、Northern印迹杂交和组织原位杂交。液相分子杂交技术包括吸附杂交、发光液相杂交、液相夹心杂交和复性速率液相分子杂交等。液相杂交是一种研究最早且技术较复杂的杂交类型,不如固相杂交那样应用普遍,主要是因为杂交后过量的未杂交探针在溶液中除去较为困难和误差较高。因此在此主要介绍固相分子杂交类型及其应用。
一、斑点杂交
1、概述
斑点杂交首先由Kafatos等发展起来,用于在同一固相支持物上固定几种核酸样品,然后用合适的探针与已固定的样品杂交,并由此判断靶序列的浓度。通过估计样品点发射出的信号的强度,与已知浓度的标准品信号强度进行比较,确定待测样品中靶序列的量。
斑点杂交的原理是将DNA或RNA变性后直接点样吸附于固相支持滤膜上,即印迹之后,膜作变性和中和处理,用UV照射尼龙膜或用烘烤法处理纤维素膜,将DNA固定。然后用标记探针与之杂交,洗涤去除未反应的探针,采用放射自显影或显色反应检测显示杂交信号,分析结果。将核酸样品点种于固相支持滤膜上,可采用手工直接点样或采用真空抽滤加样器。后者点样准确方便。
2、杂交方法【1】(1)、材料
20×SSC,甲醛,去离子甲酰胺。10%SDS,20×Denhardt液,1mol/L磷酸一氢 …4…
钠(PH7.0),底物缓冲液,亲和素-碱性磷酸酶,5-溴-4-氢-3-吲哚乙酸,淡蓝四唑等。其他还有恒温水浴锅、同位素探测仪、自动光密度扫描仪、真空抽滤加样器、恒温摇床、移液器、印迹等。(2)、操作步骤和方法
①样膜的制备
a.核酸样品的预变性 所取DNA及RNA样品的量视情况而定,一般可加10~20ug.b.尼龙膜的预处理 c.点样 d.固定
②预杂交
③杂交 a.配制杂交液 b.探针变性 c.杂交
④洗膜
⑤放射自显影
⑥结果观察
根据曝光点的有无、强弱,可以判定目的基因的有无及用量的多少。利用自动灰度扫描仪扫描曝光点,计算光密度值,可以进行半定量分析。对光敏生物素标记DNA探针的斑点杂交,出现蓝紫色斑点者为阳性,未着色者为隐性。根据着色的深浅可以判定目的基因的多少。(3)、注意事项
①DNA的变性 斑点印迹的关键是DNA在转录后要完全变性,至少所有样品的变性程度要一致。
②DNA样品的纯度 用Southern转移时,电泳步骤有利于把杂质分出去,剩下要转移的DNA就比较干净。
③固相支持膜的选择 理想的膜应符合以下要求:a.具有较强的结合核酸分子的能力;b.与核酸分子的结合稳定牢固;c.与核酸分子结合后,应不影响其与探针分子的杂交反应;d.非特异性吸附少;d.具有良好的机械性能。(4)、斑点杂交的应用 【2】
…5…
现在已有众多学者应用该方法进行分支杆菌及其他病原菌的检测和种属鉴定,均取得了较敏感的检测结果。同时应用该方法检测序列变异时,若靶序列内存在突变,则其扩增产物在严格的条件下无法与探针杂交,无杂交信号就表示目的基因存在突变。近年来研究应用于单个碱基突变基因的诊断方法,其最大的特点就是简便、快速而分辨率高。其最突出的优点是进行一个标本的基因分型只需1次杂交即可完成配合快速的DNA提取方法及电脑分析软件得出,可以在一个工作日内完成所需的分型工作。
二、Southern印迹杂交
1、Southern印迹杂交的基本原理【3】
Southern印迹杂交指将经凝胶电泳分离的DNA片段转移到合适的固相支持物上,再通过特异性的探针杂交来检测被转移的DNA片段的一种技术。其基本过程包括:样品DNA的限制性内切酶水解,水解片段的琼脂糖凝胶电泳分离,分离后水解片段的转移,特异性的DNA片段的分子杂交,探针在杂交前用放射性标记或酶学标记,最后采用放射自显影或化学发光法进行检测。
2、Southern印迹法的基本过程【4】(1)、DNA样品的酶切和电泳
a.用适当的限制性内切酶消化基因组DNA样品;b.琼脂糖凝胶电泳(2)、准备用于转移的凝胶
(3)、DNA从琼脂糖凝胶转移到固相支持物
a.缓冲液的配制;b.准备转移用膜;c.固定DNA于膜上
(4)、探针标记(5)、杂交
a.缓冲液及溶液
磷酸-SDS洗液Ⅰ
SDS洗液Ⅱ
预杂交/杂交液;b.预杂交;c.杂交(6)、洗膜
取出NC膜,在2×SSC溶液中漂洗5min,然后按照下列条件洗膜:
2×SSC/0.1%SDS,42摄氏度,10min
1×SSC/0.1%SDS,42摄氏度,10min
0.5×SSC/0.1%SDS,42摄氏度,10min
0.2×SSC/0.1%SDS,56摄氏度,10min …6…
0.1×SSC/0.1%SDS,56摄氏度,10min 实践证明,当放射强度指示数值较环境背景高1~2倍时,是洗膜的终止点。上述洗膜过程中无论哪一步到达终点。都必须停止洗膜。(7)、杂交结果的检测
a.放射性核酸标记探针的检测
洗膜结束后,将洗完的膜浸入2×SSC中2min,取出膜,用滤纸吸干膜表面的水分,并用保鲜膜包裹。将膜正面向上,放入暗箱中,经磷钨酸钙增感屏前屏置于滤膜下,光面向上。在暗室的红光下,将两张X射线胶片压在杂交膜上,再压上增感屏后屏,光面向X射线胶片。合上暗盒,置-70摄氏度低温冰箱中曝光。根据放射性的强度曝光一定时间后,在暗箱中去除X射线胶片,显影、定影,一般用1~3天时间。洗片时,先洗一张X射线胶片,若感光偏弱,则多加两天曝光时间,再洗第二张片子。b.非放射性核酸标记探针的检测(8)、杂交膜的重复使用
将结合有探针的杂交膜浸入大量的洗脱液中,75摄氏度下温育2h或在含有50%的甲酰胺与2×SSPE的溶液中于65摄氏度下保温1h.然后取出杂交膜,在室温下用0.1%×SSPE短暂漂洗,再将杂交膜置于纸巾上。除去大部分液体。用保鲜膜包裹。置暗箱中进行放射自显影,以检查是否所有探针已被除去,如果没有杂交信号,说明探针已被洗脱干净,可以用于第二轮杂交或干燥后保存备用。(9)、注意事项
a.杂交膜只能用干净的平头镊子接触,不可接触手指,否则将造成背景问题。b.电泳结束后,应该确定酶切是否完全、电泳分离效果是否良好、DNA样品有无降解等。
c.硝酸纤维素膜只能通过彻底干燥来进行固定,干燥后核酸与硝酸纤维素膜通过疏水相互作用力结合在一起,相互之间的结合力较弱。d.杂交体系的体积越小,效果越好。
e.杂交膜上出现斑点可能是由于封闭液中封闭剂浓度过低或封闭缓冲液配制时间过长,不能封闭杂交膜上的非特异性位点。
f.采用毛细管转移法进行核酸转移时,用prarfilm膜围绕凝胶周边,但不是覆盖凝胶,依次作为屏障,阻止液体自流池直接流至凝胶上方的纸巾层中,纸巾对方不整齐容易从凝胶的边缘垂下并与平台接触,这种液流的短路是导致凝胶中核酸转 …7…
移效率下降的主要原因。
3、Southern杂交的应用进展【5】
不同个体在DNA结构上存在着差异,在不编码蛋白质的区域及没有重要调节功能的区域,DNA结构的个体差异更为明显。基因组中一个特定的基因座位若存在两种或两种以上的状态,而且其中任何一个等位基因在人群中的频率不低于10%,这一现象称为多态性。DNA多态性本质上是染色体DNA中核苷酸数目或排列顺序的个体差异。
(1)、限制性片段长度多态性(RELP)
这种在同种生物不同个体间出现不同长度限制性片段的类型,称为限制性片段长度多态性(RELP)。RELP具有极广泛的用途,利用广泛分布的RELP作为遗传标记可以称为对人类基因组制图的基础。当多态性顺序与人类遗传病基因位点相连锁时,可以作为遗传缺陷的产前诊断或鉴别杂合子携带者的标记,以及用于亲子鉴定和群体研究等。主要方面包括:①生物体基因分型、分亚型;②癌基因分析;③遗传病的诊断④HLA分型及遗传结构分析。(2)、可变串联重复多态性(VNTR)
人类基因组含有一些DNA重复序列家族,有些重复序列分散在基因组中,有些是以一系列短的串联重复序列组成高变区,其串联;串联重复序列拷贝数可以相差很多,即出现可变数的串联重复,因而高变区的长度变化很大,使高变区两侧限制性内切酶识别位点的固定位置随高变区的大小变化而发生相对位移,造成RELP,称为VNTR多态性。
迄今为止,VNTR的研究方法主要有四种:DNA指纹图谱法、VNTR-RELP分析法、模板PCR扩增后的RELP或寡核苷酸探针(ASO)检测法以及PCR扩增片段长度多态性分析法。(3)、扩增片段长度多态性(AELP)该法的分辨率、灵敏度明显高于琼脂糖凝胶电泳、放射性自显影的方法,并且操作时间短,一般2h即可完成。他几乎克服了Southern印迹杂交技术中的所有缺点,使VNTR在琼脂糖电泳中连续分布的等为基因片段变成单独分离的片段,使原来无法用Hardy-weinberg公式进行计算的基因频率估计称为可能。因此,该技术在遗传病诊断、基因定位,尤其是法医学上的应用日益广泛。
三、Northern印迹杂交
…8…
1、Northern印迹杂交的基本原理【6】
与Southern杂交相似,Northern杂交也采用琼脂糖凝胶电泳,将分子量大小不同的RNA分离开来,随后将其原位转移至固相支持物上,再用放射性标记的DNA探针或RNA探针,依据其同源性进行杂交,最后进行放射自显影。以目标RNA所在位置表示其分子量的大小,而其显影强度则可提示目标RNA在所测样品中的含量。
2、杂交方法【7】
Northern杂交方法是单一基因表达分析的首先方法。经过二十多年的发展,Northern杂交方法比以前有了较大改进,其操作方法变得更加简单,时间也比以前缩短了,其基本操作过程分以下几大步骤: ①RNA的变性和分离 ②RNA转移至固相支持物中 ③固相RNA与探针分子杂交
④对特异结合的探针分子进行检测和分析。
3、northern杂交的应用与进展【8】
RNA凝胶印迹分析即Northern杂交分析,是分子生物学最常用的研究基因表达的方法。它可以将恒定的mRNA水平量化,同时给出相关的RNA是否存在、分子大小以及离散的RNA种类间的整体性等信息。近年又出现了一些可以定量检测RNA的更灵敏的技术,如核酸酶保护分析、RT-PCR等方法,但这些技术只是Northern杂交方法的补充而并非取代。Northern杂交仍被看作是mRNA研究的标准操作,以为它相对简单并且可获得关于mRNA的多种信息。
(1)、反向Northern杂交和Northern杂交筛选mRNA表达(2)、高通量反向Northern印迹杂交和Northern杂交
四、原味杂交
1、基本原理【9】
原位核酸分子杂交技术简称原味杂交(ISH),是应用序列已知并带有标记物的核酸探针与组织、细胞中待检测的核酸按碱基互补配对原则特异性结合而形成杂交体,然后再应用与标记物相应的检测系统,通过组织化学或免疫组织化学方法在被检测的核酸原位形成带颜色的杂交信号,在显微镜下进行观察,从而对组织细胞中的待测核酸进行定性、定位和相对性定量的一种研究方法。原味杂交属于固 …9…
相核酸分子杂交的范涛,但它区别于固相核酸分子杂交中其他任何一种核酸分子杂交技术。原味杂交可检测形态保存完整的染色体、细胞或组织切片中的特异核酸序列,与免疫细胞化学结合时,原位杂交还可将显微拓扑学信息与DNA、mRNA及蛋白质水平的基因活动联系起来,为从分子水平研究细胞内基因表达及基因调控提供了有效的工具,是组织化学或免疫细胞化学中革命性的突破。
2、原味杂交技术的基本方法【10】
原位杂交技术主要涉及四个方面:①杂交前准备,包括玻片准备、组织的固定及预处理、预杂交;②杂交;③杂交后处理,涉及杂交后的清洗;④显示及结果观察,显示包括放射自显影和非放射性标记的组织化学或免疫组织化学显色。(1)、破片准备和组织固定
玻片包括盖玻片和载玻片,应用热肥皂水清洗,用自来水清洗干净后,置于清洁液浸泡24H,清水洗净烘干,95%乙醇中浸泡24H后用蒸馏水冲洗、烘干,烘箱温度最好在150摄氏度或以上,过夜以除去任何RNA酶。
为保持细胞形态结构的完整及其DNA或RNA含量及位置尽可能的稳定,被测的生物样品必须固定。DNA比较稳定而RNA很容易降解,对于DNA的固定来说,固定剂的种类和浓度并不十分重要。(2)、样品的预处理
①内源性酶的灭活;②RNA酶的处理;③盐酸处理;④去污剂处理;⑤蛋白酶处理
(3)、预杂交
为防止背景污染,有时要进行预杂交。预杂交液和杂交液比较起来只是不含探针和硫酸葡萄糖,其他成分相同。如果检测染色体DNA,预杂交及杂交中的DNA必须先变性,但变性处理可能破坏染色体的形态,实际操作时,必须找到适当的方法在杂交信号与形态间取得平衡。(4)、杂交
杂交是将杂交液滴于切片组织上,加盖硅化的盖玻片以防止孵育过程中杂交液的蒸发,然后将玻片放在湿盒中进行孵育。(5)、杂交后的清洗
杂交后的清洗是为了除去非特异性的杂交,即探针与部分同源序列的结合、这种非特性杂交会干扰特异的杂交信号。由于这种杂交体的稳定性不及完全互补配 …10…
对的杂交体,控制杂交后洗脱液的严谨度就可以除去非特异的杂交,即采用系列不同浓度、不同温度的盐溶液逐步漂洗。(6)、免疫学检测
根据核酸探针标记物的种类分别进行放射自显影或利用酶检测系统进行不同显色处理。细胞或组织的原位杂交切片在显示后均可进行半定量的测定。非放射性核酸探针杂交的细胞或组织可利用酶检测系统显色,然后利用显微分光光度计对不同类型数量的核酸显色强度进行检测。
3、原位杂交的应用方向
原位杂交区别于固相核酸分子杂交中的任何一种核酸分子杂交技术。其他杂交方法正能证明该病原体、细胞或组织中是否存在待测的核酸而不能证明该核酸分子在细胞或组织中存在的部位,而原位杂交是经适当处理后,使细胞通透性增加,让探针进入细胞内与DNA或RNA杂交,因此可以确定探针的互补序列在胞内的空间位置,这一点具有重要的生物学和病理学意义。例如,对致密染色体DNA的原位杂交可用于显示特定的序列的位置;对分裂期间核DNA的杂交可研究特定序列在染色质内的功能排列;与细胞RNA的杂交可精确分析任何一种RNA在细胞中和组织中的分布。此外,原位杂交还是显示细胞亚群分布和动向及病原微生物存在方式和部位的一种重要技术。
五、菌落原位杂交【11】
菌落原味杂交是将细菌从培养平板转移到硝酸纤维素滤膜上,然后将滤膜上的菌落裂解以释放出的DNA。将DNA烘干固定于膜上与磷32标记的探针杂交,放射自显影检测菌落杂交信号,并与平板上的菌落对位。实验步骤如下:
①将硝酸纤维素滤膜置于含抗生素的平血琼脂培养基上,用无菌牙签挑去单菌落种于滤膜和主琼脂平板上,排列成方格栅,膜和板上菌落位置相同。②培养细菌至产生1~2mm大小的菌落。
③在一块平血中置4张滤纸,用10%SDS浸透,倒掉多余液体。将带有菌落的滤膜取下,轻轻置于滤纸上,菌落面朝上,注意防止在滤膜底面存有气泡。④5min后,将滤膜转至用变性溶液,(0.5mol/L NaCl,0.5mol/L Tris-NaCl)浸湿的滤纸上,放置10min。
⑤将滤膜转至中和溶(0.5mol/L NaCl,0.5mol/L Tris-HCL,Ph8.0)浸湿的滤纸上,…11…
放置10min。重复中和一次。
⑥将滤膜移至用2×SSPE溶液浸过的滤纸上,放置10min。SSPE配成20×贮备液:3.6mol/L NaCl,0.2mol/L NaH2PO4(Ph7.4),20mmol/L EDTA(Ph7.4)。⑦将滤膜将滤纸吸干,80摄氏度真空烘干2h。
致谢:
化学工业出版社及生物-医药出版社联合出版的《核酸分子杂交技术》 参考文献:
[1] 疯作化,皇甫永穆主编,医学分子生物学。第2版,武汉:武汉出版社,2000 [2] 黄培堂等译,分子克隆实验指南,第3版,北京:科学出版社,2002
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第五篇:基因工程论文(范文模版)
浅析基因工程技术的应用现状
动物医学专业
任课教师
指导教师姓名
摘要: 基因工程作为一门理论性与实践性较强的学科,其方法与技术已经渗透到现代生命科学的各个分支领域,成为生命科学的一门核心技术。基因工程包含许多独特的实验方法和技术,不仅内容丰富,涉及面广,实用性也强。基因工程是通过DNA 重组技术, 获得具有特殊生物遗传性状和功能的遗传工具生物体, 基因工程技术广泛应用于农业、医学、食品工业等。本文就基因工程的应用现状综合阐述。关键词 : 基因工程;应用现状
0.前言
基因工程技术是一项极为复杂的高新生物技术, 它利用现代遗传学与分子生物学的理论和方法, 按照人类所需, 用DNA 重组技术对生物基因组的结构和组成进行人为修饰或改造, 从而改变生物的结构和功能, 使之有效表达出人类所需要的蛋白质或人类有益的生物性状[1]。基因工程从诞生至今, 仅有30 年的历史, 然而, 无论是在基础理论研究领域, 还是在生产实际应用方面, 都已取得了惊人的成绩。首先,基因工程给生命科学自身的研究带来了深刻的变化。目前科学家已完成了多种细胞器的基因组全序列测定工作。其次, 基因工程具有广泛的应用价值, 能为工农业生产、医药卫生、环境保护开辟新途径。
1.基因工程
1.1 概念
基因工程(又称DNA 重组技术、基因重组技术), 是20 世纪70 年代初兴起的技术科学, 是用人工的方法将目的基因与载体进行DNA重组, 将DNA 重组体送入受体细胞, 使它在受体细胞内复制、转录、翻译, 获得目的基因的表达产物。这种跨越天然物种屏障, 把来自任何生物的基因置于毫无亲缘关系的新的寄主生物细胞之中的能力, 是基因工程技术区别于其他技术的根本特征。1.2 基因工程研究内容
(1)从复杂的生物有机体基因组中, 经过酶切消化或PCR 扩增等步骤, 分离出
带有目的基因的DNA 片段。
(2)在体外, 将带有目的基因的外源DNA 片段连接到能够自我复制并具有选择记号的载体分子上, 形成重组DNA分子。
(3)重组DNA 分子转移到适当的受体细胞, 并与之一起增殖。
(4)从大量的细胞繁殖群体中, 筛选出获得了重组DNA 分子的受体细胞克隆。(5)从这些筛选出来受体细胞克隆, 提取出已经得到扩增的目的基因, 供进一步分析研究使用。
(6)将目的基因克隆到表达载体上, 导入寄主细胞, 使之在新的遗传背景下实现功能表达, 产生出人类所需要的物质。
2.基因工程的广泛应用
2.1 在农业上的应用
2.1.1 抗除草剂的植物基因工程
资料表明, 每年杂草造成的经济损失占农作物总产值的10%-20%左右尽管除草剂的使用, 对大规模机械化耕作, 减少劳力开支和提高量有极为重要的作用, 但一般除草剂的选择性较差, 即除了杀草以外, 还会将作物杀死。现在利用生物技术, 将能抵抗除草剂的基因转移到植物中, 获得抗除草剂的植物, 如美国的孟山都公司将除草剂草甘磷的靶酶(EPSPS)的cDNA 克隆转入油菜[2] , 目前, 已获得的抗除草剂作物有大豆、棉花、玉米、水稻和甜菜等20 多种。2.1.2 抗虫的植物基因工程
生物防治害虫的工作已经开展多年, 主要是利用苏云金杆菌中的毒蛋白(结晶蛋白)对害虫有毒害作用, 使用这些杆菌来控制害虫。现在, 人们可以通过克隆这些毒蛋白的基因(Bt 基因)并把这些基因转移到植物细胞中, 从而获得能抗虫的转基因植物。目前, Bt 基因已被转入烟草、番茄、马铃薯、水稻、玉米及棉花等多种植物中。1996 年转Bt 基因棉花在美国种植66 万hm2 经中国农科院棉花所引进在华北试种两年, 在多点表现突出, 在完全不喷杀虫剂的情况下, 单产仍然高于喷撒2-3 次杀虫剂的中国推广棉花[3] , 显示出了控制棉铃虫的极好前景。2.1.3 动物转基因育种
动物基因工程研究主要集中在改良家畜、家禽的经济性状和通过转基因动物进行药物或蛋白质的生产等方面, 目前已取得了显著的成就, 先后培育出转基因猪、羊、牛和鱼等, 另一种转基因猪是带有人体基因的猪, 这种转基因猪客望能解决人体移植动物器官的遗体排斥问题。随着动物基因工程技术的逐渐成熟和转人体血红蛋白的基因猪、转人体血清蛋白的基因山羊等的问世, 不仅能生产出大量人类所需的血红蛋白、白蛋白等药物而且为动物育种开辟了一条全新的途径。
2.2 在医学上的应用 2.2.1 基因工程药物
利用基因工程技术开发新型治疗药物是当前最活跃和发展最快的领域。自1982 年世界第一个基因工程药物---重组胰岛素投放市场以来, 基因工程药物就成为制药行业的一支奇兵, 每年平均有3-4 个新药或疫苗问世, 开发成功的约50 个药品, 诸如人胰岛素、忍尿激酶、人生长激素、干扰素、激活剂、乙肝疫苗等广泛应用于治疗癌症、肝炎、发育不良、糖尿病和一些遗传病上, 在很多领域特别是疑难病症上, 起
到了传统化学药物难以达到的作用[4, 5, 6]。为治愈癌症正在研制的用单克隆抗体制成的“生物导弹”, 就是按照人类的设计, 把“生物导弹”发射出去, 精确的命中癌细胞, 并炸死癌细胞, 而不伤害健康的细胞, 比如专门用于肿瘤的“肿瘤基因导弹”等。可见, 生物工程药物将成为21世纪药业的支柱。而脱氧核糖核酸或者基因疫苗的问世, 变革了机体的免疫方式。如今, 人们翘首关注困扰人类的艾滋病病毒疫苗的早日问世。
尽管目前诱变育种技术仍是改良微生物工业生产菌种的主要手段,但是基因工程技术在改良工业生产菌种方面已有成功的报道。最常见的是将控制药物合成关键步骤的酶基因克隆,通过适当的载体转移到原生产菌中,以使控制限速步骤的酶水平,从而提高产量。Malmberg等[7]构建了一种带有编码赖氨酸ε-氨基转移酶基因(lysine-ε-aminotranster-ase,LAT)这种控制Streptomyces clavuligerus生物合成头霉素C的限速步骤的关键酶的基因(lat)的高拷贝质粒,并转入这种头霉素产生菌,使LAT提高活力提高了4倍,在2 L发酵罐中产生头霉素的能力是原来的2倍,重组菌胞外LAT产物α-氨基己二酸的积累量也比原受体
菌高。伊维菌素(ivermectins)是一个市场很大的抗虫
抗生素,其前体阿弗米丁(avermectins)的产生菌种的发酵液中有8个以上的组分,其中只有B1a组分才是制备伊维菌素的原料。Ikeda等[8]经过近十年的努力,已将阿弗米丁的生物合成基因簇全部搞清,并经过诱变与DNA重组,获得了仅产阿弗米丁B2a单一组分和B1a、B2a组份的重组工程菌,这不仅大大提高了阿弗米丁有效组分的发酵效价,且给提取、精制、半合成等后处理工序带来了很大的便利。可以预见,随着对各种工业生产的微生物药物生物合成途径的深入了解以及基因重组技术的不断进展,应用基因工程方法定向构建高产菌株的成功实例将越来越多。在抗生素发酵过程中供氧往往是一个限制因素,充足的氧气供给是药物工业发酵稳定和提高产量,降低成本的关键。传统的解决方法如增加通气量等对设备要求高,能量消耗大。20世70年代末在专性好氧菌透明颤(Vitreoscilla)中发现了血红蛋白(VHb),它能促进氧气扩散到细胞末端氧化酶上。于是人们想到了将其基因Vgb克隆到其它微生物中,以促进微生物在低氧条件下生长。
1988年Khosla等[9]从Vitreoscilla中分离出Vgb基因并将之转入大肠杆菌(E·coli),提高了大肠杆菌在溶氧量低于5%时对氧的利用率。目前已用克隆表达VHb的方法提高了放线紫红素、头孢霉素C、红霉素等产生菌及青霉素酰化酶基因工程菌的产量[10]。血红蛋白基因工程的研究和应用,必将对抗生素工业和其它重组药物发酵工业的节能等带来美好的前景。作为半合成头孢菌素类抗生素重要原料的7-氨基头孢烷酸(7-ACA),目前国内外仍以化学裂解头孢菌素C的工艺路线为主。国内外已报道可用经由GL-7-ACA的二步法(化学/酶法或二步酶法)来生产7-ACA,与化学裂解法相比不仅收率提高,且能大大减少环境污染,简化生产工艺。但二步法中关键的GL-7-ACA酰化酶在假单胞菌中表达量低而且分离纯化困难,限制了这种方法的应用。通过将GL-7-ACA酰化酶基因转入大肠杆菌中表达恰好可以解决这一问题[11]。最近又报道可将编码2个酶的基因直接转入头孢菌素C的生产菌种中,使其在发酵时直接产生7-ACA。调节基因在药物的生物合成中也起着重要作用,增加调节基因的基因量能够大幅提高药物产量。Hopwood等将放线紫红素生物合成的一个调节基因actⅡ导入原产生菌,尽管基因的拷贝数仅增加了2倍,放线紫红素的产量却增加了30~40倍。某些抗生素生产菌的产量不高,是由于其自
身对该抗生素的抗性不高。因此,利用高拷贝质粒的基因量效应,增加菌种对自身产生的抗生素的抗性,可能增加抗生素的产量。例如,将氨基糖苷-6-乙酰转移酶基因导入卡那霉素和新霉素产生菌,由于提高了对氨糖类抗生素的抗性,产量提高了2~6倍 2.2.2 基因治疗
基因治疗是指由于某种基因缺陷引起的遗传病通过转基因技术而得到纠正。临床实践已经表明: 基因治病已经变革了整个医学的预防和治疗领域。比如白痴病, 用健康的基因更换或者矫正患者的有缺损的基因, 就有可能根治这种疾病。现在已知的人类遗传病约有4000种, 包括单基因缺陷和多基因的综合症。运用基因工程技术或基因打靶的手段, 将病毒的基因杀灭, 插入矫正基因, 得以治疗、校正和预防遗传疾病的目的。目前, 基因治疗已扩大到肿瘤、心血管系统疾病、神经系统疾病等的治疗[12]。人类也已成功实现了肾、心、肝、胰、肺等器官的移植, 也有双器官和多器官的联合移植。
基因治疗有两种途径: 一是体细胞的基因治疗, 一是生殖细胞的基因治疗。由于生殖细胞的基因治疗操作技术异常复杂, 又涉及伦理缓行之理充足, 故尚无人涉足[13]。基因工程是20 世纪生命科学中最伟大的成绩, 开辟了生命科学的新纪元。经过几十年的发展, 基因工程技术已成为一个巨大的朝阳产业, 它可以超越动物、植物、微生物之间的界限, 创造出新的生物类型。基因工程不仅在医学上应用广泛, 而且也广泛应用在工业、农业、冶金、环保、资源、能源、畜牧渔业等领域, 为人类的丰衣足食和健康长寿提供了持续的实用价值很高的产品, 发展前景极为广阔。
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—谈基因工程技术如何应用于植物
摘要:通过基因工程改良品种在未来的农业生产中日益显示出巨大潜力。尽管科学家们对转基因植物的争论仍在继续,但可以肯定的是,转基因植物作为一项新兴的生物技术的产物,在解决日益膨胀的地球人吃饭问题和在解决长期困惑人类发展的资源短缺、环境恶化、经济衰退三大难题中起着越来越重要的作用。本文综述了基因工程技术在植物中的应用,就转基因植物的技术、发展、安全性和发展前景作了探讨。
关键词:基因工程技术;转基因植物;安全性;发展前景
所谓转基因植物是指利用基因工程技术,在离体条件下对不同生物的DNA进行加工,并按照人们的意愿和适当的载体重新组合,再将重组DNA转入生物体或细胞内,并使其在生物体内或细胞内表达的植物。自1983年首次获得转基因植物以来,转基因技术发展十分迅速,成功的转基因植物已达60多种,在世界上批准进入田间试验的转基因植物已超过500例。
1植物的转基因技术
由于植物的体细胞具有全能性,即单个的细胞经过合适培养后可以生成完整的植株。将分离能够编码所需产物的DNA片段克隆到适当的载体DNA中形成重组DNA,利用细菌繁殖扩增重组DNA并将重组DNA中的目的基因导入所需的培育的植物细胞中,筛选出所需要的细胞,通过细胞的全能性将转基因植株大规
模种植。
其中外源基因导入植物细胞的方法可分为DNA直接转化和以载体为媒介的基因转化。基因的直接转移是通过物理化学法将外源基因转入受体植物细胞的技术。常用的方法有化学刺激法、脂质体法、显微注射法和基因枪法等。其原理是利用物理化学方法暂时改变膜通透性,使DNA进入细胞,并最终整合到植物基因组中。
以载体为媒介的基因转化即使通过农杆菌或植物病毒介导感染受体植物将外源基因转入植物细胞的技术。目前,载体法主要包括土壤农杆菌Ti质粒、Ri质粒及植物DNA病毒等介导的遗传转化法。
2转基因植物的筛选与检测
通过转基因的方法将目的基因转入目的植物的细胞后,转化细胞与非转化细胞相比都只占少数,两者存在竞争,而转化细胞的竞争力通常比非转化细胞弱,因此必须对转化细胞进行筛选和检测。
在构建重组DNA时,人们已经引入了标记基因以对转化子选择和鉴定。报告基因由于其表达产物易于检测,已广泛用于转基因植物中。根据报告基因编码特点,大致分为两类:抗性基因和编码催化人工底物产生颜色变化的酶基因或发光基因。根据检测的不同阶段区分,有DNA检测法、RNA检测法及蛋白质检测法。DNA检测法只能检测到外源基因是否已经整合到植物基因组中,而RNA检测法得到的结果可判定外源基因是否转录,蛋白质检测法则可检测出外源基因是否翻译。
3改进转基因的技术
随着植物转基因技术的创立和发展,许多具有重要经济价值的农作物获得了转基因植株,植物转基因技术成为植物育种的一个重要手段,但仍有许多问题阻碍了转基因技术在生产上的广泛的应用。将外源DNA导入植物细胞后,只有外源DNA在宿主细胞及其子代细胞中稳定整合和有效的表达,才能培育出具有新的遗传性状的转基因植物。大量研究表明外源基因在转基因植物中有的能正常表达,有的表达量很低,甚至不表达,而且在不同的植株个体之间也存在着明显差异。所以提高转基因的表达,减少转基因的失活是转基因技术的一个重要内容。提高外源基因表达水平的措施有: 3.1农杆菌介导的遗传转化方法由于其产生的拷贝数相对较少,可以在一定程度上避免这个问题。
3.2使用信号肽,每种植物蛋白质的作用空间位置都是不同的,蛋白质分子的定向运输需要特殊多肽信号的引导作用。3.3选择强启动子和诱导型启动子
3.4使用强终止子 常用的终止子时CaMV35S终止子和根瘤土壤杆菌T-DNA的胭脂氨基酸合成酶基因的nos终止子。
3.5消除甲基化的影响 在载体上加上去甲基化功能的序列以防止甲基化。3.6使用植物偏爱的密码子 3.7使用MAR序列 3.8使用增强子
3.9对外源基因进行修饰和改造 3.10以叶绿体作为转化受体 3.11使用一些病毒编码蛋白
3.12在有性生殖后代中筛选单拷贝植株
4基因工程在农作物上的应用
4.1抗虫转基因作物
最早获得的转Bt(苏云金杆菌)毒素基因植物是烟草和番茄,随后Bt毒素基因相继被转化到许多其他农作物中,如棉花、水稻、玉米等,获得了一大批具良好抗虫性的转基因植物品种。4.2抗病毒作物
植物病毒感染时一个严重的问题,它可导致农作物生长缓慢、产量降低和质量减退。转基因植物的成功使作物抗病毒成为可能并加速了作物抗病育种的研究进程。自1986年Powel-Abel首次将烟草花叶病毒(TMV)外壳蛋白(Cp)基因导入烟草,培育出抗TMV植株以来,已经将许多 病毒成功的构建了多种抗病毒植株,近几年的研究结果表明病毒外壳蛋白在系统杂交保护中起着重要的作用,插入一段已克隆的CP基因可以延缓病毒的发展和阻止病毒在转基因植株中进一步传播。
4.3抗细菌和真菌作物
细菌和真菌病在全部植物病害中造成的损失最大,很多科学家都在尝试从植物的生物体内寻找抗病原菌的蛋白及其基因,并将其用于植物基因工程。自1980年,瑞典科学家首次从美国惜古比天蚕种成功分离了3种诱导型的杀菌肽进行了深入的研究。它们对很多种植物病原菌有较强的杀伤作用。现在的实验结果表明,杀菌肽作用于细胞的细胞膜,破坏膜的完整性,造成离子通道,最终导致细胞内含物泄露。目前,杀菌肽基因工程已经在烟草、马铃薯等植物上有了初步报道。
4.4抗除草剂转基因作物
人类自有农业起就一直跟杂草作斗争,它是农业生产中的大敌,但由于它具有较强的生态适应性和抗逆性,所以给杂草的防治带来了困难。在大量使用化学除草剂的同时往往会对作物造成一定的伤害。为此人们在研究抗除草剂基因,将该基因转入植物,在喷施除草剂杀死杂草时,不伤害作物。20世纪80年代中期,抗除草剂基因被转入了作物体内,从而获得了抗除草剂的转基因大豆、棉花、玉米、油菜、小麦等。
4.5抗非生物胁迫作物
干旱时困扰农业生产的重要因素之一,它给农业生产带来巨大的损失,这种损失甚至是毁灭性的。CMO基因是合成乙酰-甜菜碱第一步反应关键酶的基因,具有很强的抗旱性。Rathinasabathi等奖烟草中的CMO基因导入水稻中,获得抗旱性较强的转基因水稻。可以相信在未来培育出的耐旱的新作物品种应该是转入多种共同作用的外源基因。
5转基因植物的安全性
..5.1转基因植物的优缺点 关于转基因植物及其安全性问题,是近年来的热 门话题,但目前国际上没有统一说法,争论不一。其主要优点:①增加食物供应,解决粮食短缺;②减少农药使用,避免环境污染;③降低生产成本,降低食物售价;④增加食物营养,提高附加价值;⑤增加食物种类,提升食物品质;⑥提高生产效率,带动相关产业发展。其主要缺点:①可能对蝴蝶等昆虫造成伤害; ②可能影响周边植物的生长;③可能使昆虫或病菌在演化中增加抵抗力或产生新的物种,因此有可能会伤害作物。..5.2转基因食品的安全性和可接受性
随着转基因技术的发展,转基因食品的安全性越来越受到人们的关注。转基因食品与传统食品相比,区别在于:首先它含有利用转基因技术导人的外源基因;其次可能存在外源基因在受体内的表达产物。由于这两种成分的不确定性以及由
此引起的次级效应,对人类健康可能有潜在的危害。目前人t fx转基因食品生物的担忧基本上可以归纳为3类:(1)转基因食品里加入的新基因无意中对消费者造成的健康危害;(2)转基因作物中的新基因对食物链其他环节无意中造成的不良后果;(3)人为强化转基因作物的生存竞争性,对自然界生物多样性的影响。其中人们最为担心的是转基因食品对人体健康是否安全,转基因食品与常规食品比较有无不安全的成分。这就需要对其主要营养成分、微量营养成分、抗营养因子的变化、有无毒性物质、有无过敏性蛋白以及转入基因的稳定性和插入突变进行检测。另外是人们对..“基因逃逸”的担心。所谓..“基因逃逸”,就是指微生物之间可以通过转导、转化、接合进行基因转移。人们主要是担心转基因作物及基因食品的有害基因是否会逃逸到人体或环境中,加快抗药性问题。如野生植物种通过受粉可能会完成抗除草剂的基因改良,会变成..“超级杂草”,由此形成的具有非自然抗逆性的植物对那些以其为生的动物们来说,可能会导致生物链的断裂。
6转基因植物的发展前景
转基因植物在人类发展史上,是人类对自然的认识和改造的结果,必将对人类的生存带来重大影响。随着人们对遗传本质认识的深化和生物技术水平的不断提高,大量的转基因植物不断涌现。通过转基因技术来改良作物的品质是一个不可阻挡的趋势,因为现在有许多问题是无法通过常规育种来解决的,特别是耐旱、耐贫瘠等作物品种的培育。例如非洲的沙漠地区,如果按照现在的育种手段,它的粮食产量根本不可能满足基本生活保证,人们现在 寄希望于通过转基因技术生产一些比较耐旱、耐贫瘠的作物,以解决因为土地可耕面积的减少而给人类带来的压力。另外,转基因技术可以改良作物的营养成分,现在非常知名的一个例子就是瑞士联邦技术研究所成功开发的金色大米,它是通过将胡萝卜素合成途径的关键基因转到水稻中去,生产出的大米是金黄色的,这种水稻含有VA的合成原料,在解决吃饭问题的同时有助于治疗因缺乏VA而导致的眼睛失明等疾病,这对于发展中国家非常重要。因此转基因技术具有广阔的发展前景。但是,在大力发展转基因食品的同时,应建立完善的转基因产品评价和监控体系。1 993年,世界经济合作与开发组织发表了..“现代生物技术食品的安全评价——概念和原则”,提出了..“质量等同性概念”,其含义是..“当某个由转基因技术生产的新食品的各项主要特征(分子学特征、遗传形状、主要营养成分等)与现有食品大致相同,则认为该新食品的安全性也与现有食品大体等同。”我国政府也于1 993年、1 996年和2 001年分别颁布了有关条例和规定,要求对转基因食品的试验、生产、应用等实行生产许可证和经营许可证制度,同时对违规试验、生产、应用、进出口转基因食品的机构和人员,规定了严厉的处罚措施。但如何维护消费者的知情权,对转基因食品实行标志制,如何加强对进口转基因食品的检验监管,保证我国的食品卫生安全等尚需进一步完善,加强研究。
综上所述,基因工程技术作为一项新兴的生物技术,其发展趋势不可阻挡。但科学技术是把双刃剑的理论同样适合转基因植物。为此,我们应该适当借鉴国外经验,建立一套既符合中国国情,又与国际接轨,且科学合理的基因安全评价和监控体系,为日后我国转基因植物走向世界奠定基础。
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摘要:基因工程抗体是继多克隆抗体和单克隆抗体之后的第三代抗体,近年来随着生物工程技术的发展,许多基因工程抗体陆续问世,本文详细介绍了基因工程抗体的研究进展,概述了基因工程抗体在临床方面的明显优势和应用潜力。关键词:基因工程抗体;研究进展;临床引用
Advances in Genetic Engineering Research and Clinical
Application of Antibody
Student majoring in Professional Veterinary Medicine Name DongChuanJun
Tutor Name MinLingJiang
Abstract:Genetic engineering antibody is the third generation antibody after polyclonal antibody and monoclonal antibody.In recent years,with the development of bio-engineering techniques,many genetically engineered antibodies have been presented to the public,and this article elaborates on research progress of the genetic engineering antibody,and its obvious advantages and potentials in clinical application.Key words: Genetically engineered antibodies;Research;Clinical application.转基因技术迅速发展,其应用和发展的领域日益夸大。但转基因技术的弊端日益凸现,引起众多关注的目光。就转基因技术本身而言,社会各界对它的态度各有异同。不同的国家不同的民族和不同的个体对转基因技术的态度大相径庭。如何看待转基因技术?如何去应用和发展转基因技术?这些都是我们亟待解决的问题。基因工程抗体介绍
1.1 基因工程简介
基因工程抗体是借助DNA重组和蛋白质工程技术,在基因水平对免疫球蛋白分子进行切割、拼接、修饰和重新组装的一种新型抗体。所制备的抗体去除或减少了可引起副作用的无关结构,但保留天然抗体的特异性和主要生物学活性,并可赋予抗体分子以新的生物学活性的总称【1】。
由于目前制备的抗体均为鼠源性临床应用时,对人是异种抗原,重复注射可使人产生抗鼠抗体,从而减弱或失去疗效,并增加了超敏反应的发生,因此,在 80 年代早期,人们开始利用基因工程制备抗体,以降低鼠源抗体的免疫原性及其功能[2]。目前多采用人抗体的部分氨基酸序列代替某些鼠源性抗体的序列,经修饰制备基因工程抗体,称为第三代抗体[3]。1.2 基因工程抗体种类
基因工程抗体主要包括嵌合抗体、人源化抗体、完全人源抗体、单链抗体、双特异性抗体等。
1.2.1 嵌合抗体
嵌合抗体(chimeric atibody)是最早制备成功的基因工程抗体。它是由鼠源性抗体的V区基因与人抗体的C区基因拼接为嵌合基因,然后插入载体,转染骨髓瘤组织表达的抗体分子【4】。因其减少了鼠源成分,从而降低了鼠源性抗体引起的不良反应,并有助于提高疗效。
1.2.2 人源性抗体
是将人抗体的CDR代之以鼠源性单克隆抗体的CDR,由此形成的抗体,鼠源性只占极少,称为人源化抗体。
1.2.3 完全人源化抗体
采用基因敲除术将小鼠Ig基因敲除,代之以人Ig基因,然后用Ag免疫小鼠,再经杂交瘤技术即可产生大量完全人源化抗体。
1.2.4 单链抗体
是将Ig的H链和L链的V区基因相连,转染大肠杆菌表达的抗体分子,又称单链FV(single chain fragment of variable region,sFv)。SFv穿透力强,易于进入局部组织发挥作用。
1.2.5 双特异性抗体
将识别效应细胞的抗体和识别靶细胞的抗体联结在一起,制成双功能性抗体,称为双特异性抗体。如由识别肿瘤抗原的抗体和识别细胞毒性免疫效应细胞(CTL细胞、NK细胞、LAK细胞)表面分子的抗体(CD3抗体或CD16抗体)制成的双特异性抗体,有利于免疫效应细胞发挥抗肿瘤作用。基因工程抗体的研究进展
2.1抗体工程的发展
最近,美FD强调:目前在临床试验中基因工程抗体约占生物制剂的30%。重组抗体的体积越来越小,或被重新构建成多价分子,或与其它分子相融合,如放射性核素、毒素、酶、脂质体和病毒的药剂设计成为可能。
【5】
。重组技术的出现使筛选、人源化、抗体的生产得到革新,并取代杂交瘤技术,从而使以抗体为基础
图1:抗体的发展
2.2目前基因工程抗体制备的主要方法 2.2.1人鼠嵌合抗体
主要是利用基因重组技术,把鼠抗体的重轻链可变区部分与人抗体重轻链恒定区的进行重组,减少鼠源结构,增加人源结构,而保持抗体与原抗原的特异性结合【6】。
1.首先把小鼠编码Ig重轻链的基因剔除。2.制备表达人的Ig重轻链的转基因小鼠。
3.上二种小鼠回交,获得只表达人Ig重轻链的基因的小鼠。当用抗原免疫后,小鼠可产生完全人源抗体。2.2.2 噬菌体抗体库技术
1.人的Ig重轻链可变区基因片段展示在噬菌体表面,组成抗体库。2.过噬菌体把抗体的表型和基因型相偶联,易进行分子克隆和基因操作。3.抗体库的来源影响筛选结果(免疫和正常人)。4.高通量筛选与抗原结合的抗体,但亲和力低。2.2.3 用人的骨髓瘤细胞直接制备全人抗体
由于骨髓瘤细胞稳定性高和融合率高,所以要建立好的人骨髓瘤细胞。2.2.4 B细胞永生化技术
用EB病毒将人淋巴细胞永生化可产生分泌抗体的B细胞克隆【7】。这一技术较为成熟,但是存在抗体分泌不稳定的缺点,限制了其应用。或直接分离分泌抗体的B细胞,用PCR获得重轻连,构建全人抗体。2.3抗体药物发展现状
1.FDA已批准上市的抗体药物。
2.SFDA(中国)已批准上市及临床研究的的抗体药物。2.4工程抗体的未来发展与展望 2.4.1单克隆抗体的市场需求
图2:单抗体市场的预测与分析 3.基因工程抗体药物的应用
随着生物工程技术的发展,许多基因工程抗体 陆续问世,并在医学领域的许多方面都具应用潜力,如病毒感染、肿瘤、自身免疫性疾病、同种异体移植物注射、哮喘、中风和青光眼治疗,尤其在诊断和治疗肿瘤性疾病及抗感染方面优势明显。
3.1基因工程抗体药物的临床应用
3.1.1 在肿瘤性疾病诊疗方面的应用
放射性标记抗体在肿瘤影像和治疗中很重要,并可有效进行药代动力学评估.以标记抗体注入人体内显示肿瘤部位抗原与抗体结合的放射浓集称放射免疫显像,由于基因工程抗体如单链抗体、Fab片段等分子量小、能很快清除、组织穿透力强,所以更适于放射免疫显像【8】。
恶性肿瘤的导向治疗,是通过重组技术将抗肿瘤相关抗原的抗体与多种分子
融合,这些分子在抗体结合靶分子后可提供重要辅助功能.这些分子包括:放射性核素、细胞毒药物、毒素、小肽、蛋白、酶和用于基因治疗的病毒.对肿瘤治疗来说,设计的双特异性抗体可有效针对低水平的肿瘤相关抗原,并将细胞毒物质输送到肿瘤细胞.此外,抗体还可与携带药物的脂质体、各种PEG偶联,从而增强体内运输和药代动力学。作为免疫脂质体,转铁蛋白受体抗体可使药物通过血脑屏障到达大脑.抗体酶复合物作为前体药物也被用于基础肿瘤治疗。3.1.2基因工程抗体的抗感染作用
预防和治疗感染性疾病常用的药物是疫苗和抗生素,但对于一些尚无有效预防及治疗手段的感染性疾病如 SARS、AIDS等,抗体治疗可做为首选方案。如在治疗AIDS方面,利用抗体工程技术已成 功地制备出HIV病毒整合菌的单链抗体ScAb2219,对HIV病毒感染的早期和晚期具有有效的抑制作用,并可望成为S基因治疗的有效手段。呼吸道合胞病毒(RSV)易引起婴儿呼吸道疾病,如细支气管炎和肺炎,并可引起严重的并发症,目前已有人源化单克隆抗体Palivizumab经美国FDA批准上市,临床实验证明无毒、副反应,并可显著降低婴儿的住院率。我国率先建立了针对SARS的基因工程抗体库,这对于 SARS的预防、诊断和治疗都将起到重要作用和深远影响。对于中和其它病原分子,FDA已批准 Fab单体分子作为抗蛇毒药物;scFv片段和寡克隆复合物作为抗细菌毒素药物。3.1.3 细胞内抗体
随着细胞信号转导和抗体工程技术的发展,诞生了细胞内抗体技术。这项技术是指在细胞内表达并被定位于亚细胞区室如胞核、胞浆或某些细胞器,与特定的靶分子作用从而发挥生物学功能的一类新的工程抗体。最典型的是 scFv,被称为内抗体。胞内抗体技术主要应用在抑制病毒复制特别是 HIV-1复制、肿瘤基因治疗方面,现已逐渐拓展到中枢神经系统疾病、移植排斥和自身免疫性疾病等领域。体外培养来源于无关供体的角质形成细胞同种移植物用于严重的烧伤病人的治疗,往往会引起排斥反应,而MHCI类分子是引起移植排斥的重要抗原。Mhashikar等用编码抗 MHC I单链抗体的腺病毒转染角质形成细胞,结果显示明显降低了MHCI的表达,细胞内抗体介导的表型敲除是否有利于同种移植物的存活还需要进一步研究。
3.1.4 用于未来诊断的生物传感器和微矩阵技术
生物传感器和微阵列技术在不久以后将有可能成为主要的体外诊断技术.对于大量诊断试剂盒,抗体有高敏感性和高特异性.从最初的玻璃界面到现在的多种蛋白亲和界面,用于诊断的抗体微矩阵界面不断发展.随着体外机械人的出现,这一技术将进一步发展,并用于微生物污染、寄生虫和生物病原体的检测。
3.2基因工程抗体药物的应用领域
1.肿瘤导向治疗;
2.哮喘、银屑病、类风湿性关节炎、红斑狼疮、急性心梗、脓毒症、多发性硬化症及其他自身免疫性疾病; 3.心脑血管疾病; 4.感染性疾病; 5.“生物导弹”
4.基因工程技术的发展方向
针对基因工程抗体药物的应用,明确基因工程技术的发展方向,从而让基因工程抗体对我们更有利[9]。
1.开发针对神经系统、肿瘤、心血管系统、艾滋病及免疫缺陷等重大疾病的多肽、蛋白质和核酸等新生物技术产品;
2.选择一批市场前景好的生物技术产品及疫苗、诊断用单克隆抗体,开发重点是乙肝基因疫苗与单克隆抗体诊断试剂等;
3.开发靶向药物主要是开发抗肿瘤药物。目前治疗肿瘤药物确实存在一个所谓“敌我不分”的问题。在杀死癌细胞的同时,也杀死正常细胞。导向治疗就是针对这个问题提出来。所谓导向治疗就是利用抗体寻找靶标,如导弹的导航器,把药物准确引入病灶,而不伤及其他组织和细胞;
4.人源化的单克隆抗体的研究开发。抗体可以对抗各种病原体,亦可作为导向器,但目前的单克隆抗体,多为鼠源抗体,其本身也被异种生物体视为抗原,当被注入人体后会诱导产生抗体或激发免疫反应。目前国外已研究噬菌体抗体技术,嵌合抗体技术,基因工程抗体技术以解决人源化抗体问题;
5.血液替代品的研究与开发仍然占重要地位。血液制品是采用大批混合的人体血浆制成的,由于人血难免被各种病原体所污染,如艾滋病病毒及乙肝病毒等,通过输血而使接受输血的人感染艾滋病或乙型肝炎的案例时有发生,因此利用基因工程开发血液替代品引人注目。
基因工程抗体的进展已使抗体制备技术进入了一个全新时代,尤其药物抗体库的进展,解决了人源抗体的研制,促进了各种性能优良抗体以及具有多种功能的抗体融合蛋白的开发,可以预见基因工程抗体的研制正在进入一个新的高峰。但是抗体的亲和力减弱,与完整抗体结构相比,功能明显就会降低。人们对可能出现的新组合、新性状会不会影响人类健康和环境,还缺乏知识和经验,按目前的科学水平还不能完全精确的预测。所以我们要在抓住机遇,大力发展基因工程技术的同时,需要严格管理,充分重视转基因抗体的安全性
【10】。
致谢:非常感谢闵令江老师在我大学的学习阶段教给自己基因工程这门学科。我从中学到了很多知识,认识了关于基因工程方面的一些问题,使自己从一无所知到现在基本认识了这门学科,在此我向老师表示我诚挚的谢意,感谢老师的诚
挚教导。
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基因工程在现代社会中的应用与前景
在基因水平上,采用与工程设计十分类似的方法,按照人类的需要进行设计,然后按设计方案创建出具有某种新的性状的生物新品系,并能使之稳定地遗传给后代,这就是基因工程。
基因工程一般包括四个步骤:一是取得符合人们要求的DNA片段,即“目的基因”。被称为“分子剪刀”的“限制性转切酶”可以在DNA分子上找到特定的“切点”,然后将认准的双链交错切断。自70年代以来,人们已找到400多种形形色色的“分子剪刀”。二是将目的基因与质粒或病毒DNA连接成重组 DNA。在用同一种“分子剪刀”剪切的两种DNA碎片中加上“分子针线”——“DNA连接酶”,就可以把两种DNA片段重新连接起来。三是把重组DNA引入某种细胞。把“拼接”好的DNA分子运送到受体细胞中去,必须寻找一种分子小、能自
由进出细胞,而且在装载了外来的DNA片段后仍能照样复制的运载体。理想的运载体是质粒,因为质粒能自由进出细菌细胞。四是把目的基因能表达的受体细胞挑选出来。目的基因的导入过程是肉眼看不到的。因此,要知道导入是否成功,事先应找到特定的标志。例如我们用一种经过改造的抗四环素质粒PSC100作载体,将一种基因移入自身无抗性的大肠杆菌时,如果基因移入后大肠杆菌不能被四环素杀死,就说明转入获得成功了。
科学家曾预言,21世纪是基因工程的世纪。基因工程对人类来说,作用是不可估量的,意义是深远的。
随着人类对基因研究的不断深入,发现许多疾病是由于基因结构与功能发生改变所引起的。科学家将不仅能发现有缺陷的基因,而且还能掌握如何进行对基因诊断、修复、治疗和预防,这是生物技术发展的前沿。这项成果将给人类的健康和生活带来不可估量的利益。
所谓基因治疗是指用基因工程的技术方法,将正常的基因转如病患者的细胞中,以代病变基因,从而表达所缺乏的产物,或者通过关闭或降低异常表达的基因等途径,达到治疗某些遗传病的目的。目前,已发现的遗传病有6500多种,其中由单基因缺陷引起的就有约3000多种。因此,遗传病是基因治疗的主要对象。
基因治疗的最新进展是即将用基因枪技术于基因治疗。其方法是将特定的DNA用改进的基因枪技术导入小鼠的肌肉、肝脏、脾、肠道和皮肤获得成功的表达。这一成功预示着人们未来可能利用基因枪传送药物到人体内的特定部位,以取代传统的接种疫苗,并用基因枪技术来治疗遗传病。
目前,科学家们正在研究的是胎儿基因疗法。如果现在的实验疗效得到进一步确证的话,就有可能将胎儿基因疗法扩大到其它遗传病,以防止出生患遗传病症的新生儿,从而从根本上提高后代的健康水平。
加快农作物新品种的培育
科学家们在利用基因工程技术改良农作物方面已取得重大进展,一场新的绿色革命近在眼前。这场新的绿色革命的一个显著特点就是生物技术、农业、食品和医药行业将融合到一起。
基因技术的突破使科学家们得以用传统育种专家难以想象的方式改良农作物。例如,基因技术可以使农作物自己释放出杀虫剂,可以使农作物种植在旱地或盐碱地上,或者生产出营养更丰富的食品。科学家们还在开发可以生产出能够防病的疫苗和食品的农作物。
基因技术也使开发农作物新品种的时间大为缩短。利用传统的育种方法,需要七、八年时间才能培育出一个新的植物品种,基因工程技术使研究人员可以将任何一种基因注入到一种植物中,从而培育出一种全新的农作物品种,时间则缩短一半。
基因工程自20世纪70年代兴起之后,经过二十多年的发展历程,取得了惊人的成绩,基因治疗
特别是近十年来,基因工程的发展更是突飞猛进。基因转移、基因扩增等技术的应用不仅使生命科学的研究发生了前所未有的变化,而且在实际应用领域——医药卫生、农牧业、食品工业、环境保护等方面也展示出美好的应用前景。
基因工程与医药卫生
目前,基因工程在医药卫生领域的应用非常广泛,主要包括以下方面: 1.基因工程药品的生产:
许多药品的生产是从生物组织中提取的。受材料来源限制产量有限,其价格往往十分昂贵。
微生物生长迅速,容易控制,适于大规模工业化生产。若将生物合成相应药物成分的基因导入微生物细胞内,让它们产生相应的药物,不但能解决产量问题,还能大大降低生产成本。⑴基因工程胰岛素
胰岛素是治疗糖尿病的特效药,长期以来只能依靠从猪、牛等动物的胰腺中提取,100Kg胰腺只能提取4-5g的胰岛素,其产量之低和价格之高可想而知。
将合成的胰岛素基因导入大肠杆菌,每2000L培养液就能产生100g胰岛素!大规模工业化生产不但解决了这种比黄金还贵的药品产量问题,还使其价格降低了30%-50%!⑵基因工程干扰素
干扰素治疗病毒感染简直是“万能灵药”!过去从人血中提取,300L血才提取1mg!其“珍贵”程度自不用多说。
基因工程人干扰素α-2b(安达芬)是我国第一个全国产化基因工程人干扰素α-2b,具有抗病毒,抑制肿瘤细胞增生,调节人体免疫功能的作用,广泛用于病毒性疾病治疗和多种肿瘤的治疗,是当前国际公认的病毒性疾病治疗的首选药物和肿瘤生物治疗的主要药物。⑶其它基因工程药物
人造血液、白细胞介素、乙肝疫苗等通过基因工程实现工业化生产,均为解除人类的病苦,提高人类的健康水平发挥了重大的作用。基因工程药品是制药工业上的重大突破。
目前用基因诊断方法已经能够检测出肠道病毒、单纯疱疹病毒等许多种病毒。
基因工程与农牧业、食品工业
基因工程在农牧业生产上的应用主要是培育高产、优质或具有特殊用途的动植物新品种。基因工程在农业方面的应用主要表现在两个方面。首先,是通过基因工程技术获得高产、稳产和具有优良品质的农作物。例如,用基因工程的方法可以改善粮食作物的蛋白质含量。其次,是用基因工程的方法培育出具有各种抗逆性的作物新品种。自然界中细菌的种类是非常多的,在细菌身上几乎可以找到植物所需要的各种抗性,如抗虫、抗病毒、抗除草剂、抗盐碱、抗干旱、抗高温等。如果将这些抗性基因转移到作物体内,将从根本上改变作物的特性。
基因工程在畜牧养殖业上的应用也具有广阔的前景,科学家将某些特定基因与病毒DNA构成重组DNA,然后通过感染或显微注射技术①将重组DNA转移到动物受精卵中。由这种受精 卵发育成的动物可以获得人们所需要的各种优良品质,如具有抗病能力、高产仔率、高产奶率和高质量的皮毛等。
在工业上,由于用微生物进行发酵生产要比在大田中进行农牧业生产具有许多优越性,因而它已成为农牧业发展的一个远景方向。而要实现这一目标,基因工程将是最有效的手段。例如,有人设想并正在试验将抗生素生产菌放线菌或霉菌的有关遗传基因转移至发酵时间更短、更易于培养的细菌细胞中;将动物或人产胰岛素的遗传基因转移至酵母或细菌的细胞中;将家蚕产丝蛋白的基因引入细菌细胞中;把人或动物产抗体、干扰素、激素或白细胞介素(interleukin)等的基因转移至细菌细胞中;把不同病毒的表面抗原基因转移到细菌细胞中以生产各种疫苗;用基因工程手段提高各种氨基酸发酵菌的产量;构建分解纤维素或木质素以生产重
要
代
谢
产
物的工
程
菌;
基因工程还可以为人类开辟新的食物来源。
基因工程与环境保护
基因工程的方法可以用于环境监测基因工程还可以用于被污染环境的净化。造成环境污染的农药,并试图通过基因工程的方法回收和利用工业废物。凡此种种,都是一些可望取得成功和发展前景十分光明的研究课题。
例如,目前用100000克胰脏只能提取3~4g胰岛素,而用“工程菌”进行发酵生产,则只要用几升发酵液就可取得同样数量的产品。1978年,美国有两个实验室合作,使E.coli产生大白鼠胰岛素的研究已获成功。接着,又报道了通过基因工程使E.coli合成人胰岛素实验成功的消息。他们在实验室中曾将人胰岛素A、B两链的人工合成基因分别组合到E.coli的不同质粒上,然后再转移至菌体内。这种重组质粒可在E.coli细胞内进行正常的复制和表达,从而使带有A、B链基因的“工程菌”菌株分别产生人胰岛素的A、B链,然后再用人为 的方法,在体外通过二硫键使这两条链连接成有活性的人胰岛素。另外,在1977年,国外已利用基因工程技术,使E.coli生产出一种名为生长激素释放因子“SRIH”的动物激素(一种十四肽,能抑制其他激素的释放和治疗糖尿病等),它原来要从羊的脑下垂体中提取,宰50万头羊也只能提取5mg的产品,而现在只要用10L发酵液就可获得同样的产量。近年来,应用遗传工程获得这类产品的例子正与日俱增,尤其是多肽类物质,如脑啡肽(大脑中的镇痛物质)、卵清蛋白(即“OV”,389肽)、干扰素(用于治疗病毒性感染)、胸腺素α-1(有免疫援助因子的作用,可治疗癌症)、乙型肝炎疫苗和口蹄疫病毒疫苗等。我国学者也急起直追,在脑啡肽、α-干扰素、γ-干扰素、人生长激素、乙型肝炎疫苗、含乙肝表面抗原基因的牛痘病毒株以及青霉素酰化酶等的基因工程研究中,取得了一系列令人鼓舞的成果。
(2)基因工程在农业上的应用基因工程在农业上应用的领域也十分广阔。有人估计,到本世纪末,每年上市的植物基因工程产品的价值,相当于医药产品的十倍。几个主要的应用领域包括:①将固氮菌的固氮基因转移到生长在重要作物的根际微生物或致瘤微生物中去,或是干脆将它引入到这类作物的细胞中,以获得能独立固氮的新型作物品种。根据估算,利用前一方法,其研究经费仅及通过常规方法发展氮肥工业以达到同样效果的二百分之一至二千分之一;而后一途径则更省事,其成本还不到上述的二千分之一;②将木质素分解酶的基因或纤维素分解酶的基因重组到酵母菌内,使酵母菌能充分利用稻草、木屑等地球上贮量极大并可永续利用的廉价原料来直接生产酒精,并可望为人类开辟一个取之不尽的新能源和化工原料来源;③改良和培育农作物和家畜、家禽新品种,包括提高光合作用效率以及各种抗性基因工程(植物的抗盐、抗旱、抗病基因以及鱼的抗冻蛋白基因)等。
基因工程的前景
从70年代起逐步建立起来的基因工程技术,使基因或一些具有特殊功能的DNA片段的分离变得十分容易。这些基因或特殊DNA片段的一级结构(即它们的核苷酸序列)的测定也是十分容易的,由基因的核苷酸序列去推测蛋白质的氨基酸残基的序列也变得轻易而举。利用计算机技术可以很容易的对推测出来的蛋白质进行高级结构的分析,可以对来自不同生物种类的基因序列进行同源性分析。所有这些方法或技术的广泛使用,不仅大大地推动了分子生物学的迅猛发展,而且也大大推动了生命科学各个分支领域的迅速发展。因此,基因工程技术的第一个重要应用领域就是大大的推动了科学理论研究的发展。
由于基因工程是从遗传物质基础上对原有的生物(常常称之为受体生物)进行改造,经过改造的生物就会按照研究者的意愿获得某种(些)新的基因,从而使该生物获得某些新的
遗传性状。这种性状可以用人的肉眼直接观察到,也可能是通过某些反应或仪器间接观察到。这种受体生物可能是微生物,植物或动物,因而它会涉及到许多生产行业。
基因工程技术几乎涉及到人类的生存所必需的各个行业。比如将一个具有杀虫效果的基因转移到棉花、水稻等农作物种中,这些转基因作物就有了抗虫能力,因此基因工程被应用到农业领域;要是把抗虫基因转移到杨树、松树等树木中,基因工程就被应用到林业领域;要是把生物激素基因转移到支物中去,这就与渔业和畜牧业有关了;如果利用微生物或动物细胞来生产多肽药物,那么基因工程就可以应用到医学领域。总之一句话,基因工程应用范围将是十分广泛的